哈佛大學(xué)教授直言:從未實(shí)際見過那么猛的系數(shù)!新冠狀病毒R0值3.8,SARS最初才2.6!-肽度TIMEDOO

最新研究:武漢肺炎R0值3.8

1月25日農(nóng)歷大年初一,在哈佛大學(xué)任教15年的流行病學(xué)家埃里克·費(fèi)格丁博士(Dr. Eric Feigl-Ding)在推特發(fā)表了對武漢肺炎的看法,引發(fā)了不小的轟動(dòng)。
他寫到:“我的圣母啊,新冠狀病毒(武漢肺炎)的R0值竟然是3.8?。?!在我的職業(yè)生涯中,從未實(shí)際見過那么猛的系數(shù)。我并不是在夸大 …”
注:一個(gè)感染者在傳染期內(nèi)在易感人群中引起的新感染者的期望人數(shù),為傳染病的傳播速率,有人稱之為基本增生速率(Basic reproduction rate, R0)。
武漢肺炎R0值3.8這一數(shù)字出自1月24日發(fā)表在在medrxiv上的一項(xiàng)最新研究,論文標(biāo)題是Novel coronavirus 2019-nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions”,研究團(tuán)隊(duì)來自英國蘭開斯特蘭開斯特大學(xué)、美國佛羅里達(dá)大學(xué)和英國格拉斯哥大學(xué)病毒研究中心。
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這項(xiàng)研究的主要發(fā)現(xiàn)包括:
1、我們估計(jì)感染的基本傳染數(shù)(????0)明顯大于1。我們估計(jì)它在3.6到4.0之間,這表明72-75%的傳播必須通過控制感染措施來阻止增長。
2、我們估計(jì),武漢市只有5.1%(95%可信區(qū)間,4.8-5.5)的感染被確定,這表明社區(qū)中存在大量感染,也反映了發(fā)現(xiàn)這種新疾病病例的困難。中國的公共衛(wèi)生部門對這種新型病原體進(jìn)行了非常迅速的監(jiān)測,從而能夠快速評估武漢和其他地區(qū)病例增長的速度。
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3、如果控制或傳播沒有發(fā)生變化,那么我們預(yù)計(jì)在中國其他城市還會(huì)發(fā)生進(jìn)一步的疫情,而且感染將繼續(xù)以越來越快的速度傳播到國際目的地。
4、我們的模型表明,往返武漢市的旅行限制不太可能有效地阻止中國各地的傳播;隨著旅行有效減少99%,2月4日,武漢以外地區(qū)的疫情規(guī)模可能只會(huì)減少24.9%。

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針對這項(xiàng)研究,埃里克·費(fèi)格丁博士發(fā)表了一系列評論:

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“2019-nCoV病毒爆發(fā)的基本繁殖數(shù)比其他的急性冠狀病毒都要高,對其病原體的防控難度也會(huì)隨之大大提高?。。 ?/section>
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“它是不能單靠封閉隔離來阻斷的。武漢99%的封城隔離,甚至都不能在接下來兩周減少瘟疫傳播的三分之一?!?/section>
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“我們可能正面臨自1918年西班牙流感之后,又一場失控的疫情。我們希望它不會(huì)重蹈1918年的覆轍,可是現(xiàn)代世界有著更快的傳播渠道?!?/section>
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針對武漢肺炎和03年非典的對比,埃里克·費(fèi)格丁博士表示:“雖然有報(bào)道稱非典型肺炎開始遏制后的R0為0.49,但世衛(wèi)組織援引專家的話說,非典型肺炎最初的R0為2.9,然后是2.0-3.5,隔離后降至0.4。但非典比武漢病毒的癥狀更明顯?!?/section>
注:此前網(wǎng)上流傳的“武漢肺炎毒高SARS八倍”的說法是按照非典隔離后的R0 0.49計(jì)算的。
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埃里克·費(fèi)格丁博士最新的一條置頂推文寫到:“另一個(gè)研究小組估計(jì)冠狀病毒的傳播為2.6(低于3.8份初步報(bào)告)。但是2.6仍然非常糟糕——每個(gè)感染者都會(huì)感染2.6個(gè)其他人。甚至作者也承認(rèn),控制冠狀病毒爆發(fā)將非常困難?!?/section>
有部分網(wǎng)友認(rèn)為埃里克·費(fèi)格丁博士在危言聳聽,我們也希望不會(huì)出現(xiàn)研究中提到的那些情況。

病毒肆虐無情,中國超算發(fā)力

超級計(jì)算作為“國之重器”,在藥物篩選和病毒突變預(yù)測上可發(fā)揮重要作用。此前,深圳超算依托曙光6000強(qiáng)大的計(jì)算能力部署了藥物開發(fā)平臺,依托這個(gè)輔助藥物設(shè)計(jì)的科技創(chuàng)新平臺,科研人員可以完成靶點(diǎn)探尋,新藥篩選,先導(dǎo)物及試驗(yàn)優(yōu)化,藥理毒理等研究工作。
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1月24日除夕夜,疫情告急,中山大學(xué)藥學(xué)院羅海彬教授提出緊急需求,需要大量計(jì)算資源,做抵抗新型冠狀病毒的藥物篩選和病毒突變預(yù)測。
深圳超算接到任務(wù)后迅速協(xié)調(diào),優(yōu)先調(diào)度出兩個(gè)分區(qū)400多個(gè)節(jié)點(diǎn)的計(jì)算資源,并同步與合作伙伴協(xié)商,調(diào)度了曙光昆山的DCU資源和商湯公司的GPU資源,群策群力迅速組建應(yīng)急工作組,天津超算和騰訊公司也表示可以立即調(diào)度資源隨時(shí)待命。
在除夕夜里短短一小時(shí)內(nèi),深圳超算已協(xié)調(diào)、對接好所有計(jì)算資源,為中山大學(xué)羅教授團(tuán)隊(duì)開通了高性能計(jì)算賬號,免費(fèi)提供所有計(jì)算資源。與時(shí)間賽跑,為生命護(hù)航,藥物篩選作業(yè)即刻進(jìn)行。
此外,根據(jù)最新消息,中國疾控中心病毒所所長許文波表示,目前該中心開始啟動(dòng)新型冠狀病毒的疫苗研發(fā),目前已經(jīng)成功分離病毒,正在篩選種子毒株。另外,中國疾控中心正在進(jìn)行新型冠狀病毒肺炎的藥物篩選。
摘自:新智元,有刪減
來源:化學(xué)科訊
參考資料:
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.23.20018549v1.full.pdf