微生物所構(gòu)建出NAD+從頭合成的新途徑
煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+,輔酶I,維生素B3的活性形式)是細胞必需的基本生命分子之一。NAD+和其相應的還原形態(tài)NADH作為質(zhì)子的受體或供體參與各種氧化還原過程(如:糖酵解、檸檬酸循環(huán)、氧化磷酸化等)。另外,在細胞的生長、分化、調(diào)節(jié)等非氧化還原過程中,NAD+作為反應底物參與核酸、蛋白質(zhì)等大分子的修飾,如NAD+參與的DNA和RNA修飾、NAD+依賴的組蛋白去乙?;AD+依賴的泛素化等。NAD+由腺苷一磷酸(AMP)和煙酰胺單核苷酸(NMN)組成。在生物體內(nèi),NAD+的合成包括從頭合成途徑和利用煙酰胺類前體的補救合成途徑。現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)兩條NAD+的從頭合成途徑:天冬氨酸途徑(Pathway I)和色氨酸-犬尿酸途徑(Pathway II)。
中國科學院微生物研究所研究員陳義華課題組在鏈霉菌次級代謝產(chǎn)物保羅霉素生物合成的啟發(fā)下,設計創(chuàng)建了從分支酸到NAD+的人工合成途徑—C3N途徑。在C3N途徑中,研究人員利用參與吩嗪類化合物(PhzE、PhzD)和保羅霉素(Pau20)生物合成的酶與芳香族化合物降解酶(NbaC)完成了從分支酸到喹啉酸的轉(zhuǎn)化;進一步利用NAD+合成途徑中的后三步反應,實現(xiàn)了NAD+分子的合成。為驗證這一途徑,研究人員將C3N途徑構(gòu)建到NAD+從頭合成缺陷的大腸桿菌中,證明C3N途徑可以獨立地高效合成NAD+,保障大腸桿菌的正常生長。
人工設計的C3N途徑突破了細胞固有的代謝網(wǎng)絡調(diào)控限制,解除了NAD+與蛋白質(zhì)合成間的耦聯(lián),經(jīng)過一系列優(yōu)化后,在大腸桿菌中實現(xiàn)了極高水平的NAD(H)積累。隨后,研究人員以重要的藥物中間體2,5-二甲基吡嗪和手性胺的制備為例,證明了在高水平的NAD(H)底盤細胞中,NAD(H)依賴的氧化還原酶的反應效率得到顯著提升,C3N途徑可應用于高值化合物的高效生產(chǎn)等領(lǐng)域。由于C3N途徑的前體分支酸廣泛分布于細菌、古菌、真菌和植物中,這一途徑在理論上具有廣泛應用潛力。人工設計的C3N途徑是利用合成生物學手段探索NAD+從頭合成問題的一個解答,為研究NAD+這類重要分子合成的基礎(chǔ)科學問題提供了新思路,并將促進涉及NAD(H)的應用研究。
相關(guān)研究成果以Construction of an alternative NAD+ de novo biosynthesis pathway為題,在線發(fā)表在Advanced Science上。陳義華組博士生丁勇和李心利為論文并列第一作者,陳義華為論文通訊作者。加拿大勞里埃大學教授Horsman、微生物所研究員陶勇、吳邊提供了指導和幫助。研究工作得到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金委員會杰出青年基金和面上項目的資助。
圖1.NAD+的人工合成途徑(C3N途徑)與自然界中NAD+的從頭合成途徑
圖2.基于C3N途徑構(gòu)建的高效NAD(H)依賴型細胞工廠示意圖
來源:中科院


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