北京大學陳雷研究組報道UNC79-UNC80調控鈉通道NALCN-FAM155A的結構機制
神經(jīng)細胞的靜息膜電位(Resting Membrane Potential, RMP)影響著神經(jīng)細胞的可興奮性,對于維持神經(jīng)細胞正常的生理功能至關重要。鈉漏通道NALCN(Sodium Leak Channel, Nonselective)介導了神經(jīng)細胞的鈉漏電流,能使靜息膜電位更加去極化,從而提高神經(jīng)細胞的可興奮性1-4。NALCN在哺乳動物中高度保守,與電壓門控鈣離子通道(CaV)和電壓門控鈉離子通道(NaV)同源性較高。NALCN參與了諸多與神經(jīng)系統(tǒng)相關的重要的生物學過程,包括呼吸節(jié)律的調節(jié)1、痛覺感知5、生物鐘的調節(jié)6和快速動眼睡眠7等。在人群中,NALCN的單點突變就會引起多種嚴重的神經(jīng)發(fā)育遺傳疾病,包括精神運動發(fā)育遲緩和具有特征面相的小兒肌張力低下癥(IHPRF)8,9,以及四肢和面部先天性攣縮、肌張力低下和發(fā)育遲緩癥(CLIFAHDD)10等。盡管NALCN通道有著如此重要的功能,但其工作機制仍不清楚。有報道顯示在HEK293細胞和爪蟾卵母細胞等異源體系中,只有共同表達NALCN,F(xiàn)AM155,UNC79和UNC80四個亞基,才能測量到明顯并且典型的鈉漏電流4。其中,NALCN是孔道形成亞基;FAM155是跨膜胞外調控亞基11,協(xié)助NALCN上膜;而UNC79和UNC80是分子量巨大(300 kDa和370 kDa),且不與任何已知蛋白具有序列同源性的胞質調控亞基3。
2022年5月12日,北京大學未來技術學院分子醫(yī)學研究所、北大-清華生命科學聯(lián)合中心、國家生物醫(yī)學成像中心陳雷研究組在Nature Communications 雜志上報道NALCN-FAM155A-UNC79-UNC80復合物的冷凍電鏡結構及UNC79-UNC80調節(jié)NALCN-FAM155A的機制。
陳雷研究組在2020年曾報道過NALCN-FAM155A亞復合體的高分辨率結構12,闡明了NALCN的鈉離子選擇性、胞外鈣離子阻塞和電壓調節(jié)特性的結構基礎,發(fā)現(xiàn)了在NALCN通道中獨有的位于II-III linker上的CIH螺旋結合在CTD上。但是UNC79和UNC80的結構以及它們是如何激活NALCN的并不清楚。本項研究主要使用結構生物學及電生理的手段,來探究UNC79和UNC80是如何激活NALCN的。先前的研究表明,UNC79和UNC80容易與NALCN-FAM155A亞復合體發(fā)生解離,因此,作者在NALCN的C末端融合了GFP,UNC80的N末端融合了與GFP高親和力結合的納米抗體以穩(wěn)定UNC79/80與NALCN間的相互作用。經(jīng)過同源蛋白篩選等步驟,作者們確定以大鼠NALCN和小鼠FAM155A, UNC79和UNC80亞基組成的復合體為研究對象,并在克服了樣品制備、數(shù)據(jù)處理等困難后,通過單顆粒冷凍電鏡技術獲得了整體分辨率為3.2 ?的四元復合物的電子密度,并搭建了準確的原子模型。結構顯示UNC79和UNC80均由富含螺旋的結構組成,這些螺旋進一步的組裝成HEAT重復或ARM重復等超螺旋結構。UNC79的N端與UNC80的C端、UNC79與UNC80的中間鉸鏈區(qū)以及UNC79的C端與UNC80的N端均存在著緊密的相互作用,形成鉗子狀的復合體,整體形狀類似于無窮號“∞”(圖1)。除了HEAT重復和ARM重復外,UNC80含有一個類泛素結構域,并且UNC79和UNC80的還各含有一個鋅指結構域。NALCN-FAM155A亞復合體位于UNC79和UNC80的中間鉸鏈區(qū)的上方,并且NALCN的跨膜區(qū)以及胞質C端結構域(CTD)并不直接與UNC79和UNC80發(fā)生相互作用。NALCN主要是通過胞內loop區(qū)與UNC79-UNC80發(fā)生相互作用的:NALCN胞質側的I-II linker中的一段β-發(fā)卡結構(UNIM-A)與UNC79發(fā)生相互作用,II-III linker中的一段loop-螺旋結構(UNIM-B)以及一段L型螺旋結構(UNIM-C)與UNC80發(fā)生相互作用(圖1)。作者將NALCN與UNC79/80發(fā)生相互作用的基序命名為UNC Interacting Motif (UNIM)。
圖1:NALCN-FAM155A-UNC79-UNC80復合體的結構
隨后作者基于該結構研究了UNC79和UNC80是如何調控NALCN活性的,發(fā)現(xiàn)UNC79, UNC80和FAM155A三個附屬亞基對于NALCN能夠正確的轉運到細胞膜上是必不可少的。當突變UNIM-A或UNIM-B以破壞UNIM-A或UNIM-B與UNC79/80的相互作用后,能夠正確轉運到細胞膜上的NALCN變得很少,鈉漏電流也變得很小,表明UNIM-A和UNIM-B與UNC79/80之間的互作對于NALCN能夠正確轉運到細胞膜上是必不可少的。這有可能是因為這些互作使UNC79/80遮擋了NALCN胞質側loop上的內質網(wǎng)滯留信號,從而促進NALCN上膜(圖2)。
圖2:UNC79-UNC80激活NALCN的機制的示意圖
與UNIM-A和UNIM-B不同的是,當突變UNIM-C以破壞UNIM-C與UNC79/80的相互作用后,NALCN的上膜和鈉漏電流的大小均不受影響,但NALCN更難以被電壓激活,電導-電壓曲線(G-V curve)發(fā)生明顯右移。作者們發(fā)現(xiàn)UNIM-C與UNC80的互作會牽引II-III linker中原本結合在NALCN的CTD上的一段螺旋(CTD Interacting Helix, CIH)與CTD發(fā)生解離,從而解除CIH的自抑制作用,激活NALCN(圖2)。
該項研究在2021年12月21日即公布在預印本BioRxiv上(https://doi.org/10.1101/2021.12.20.473568)。在2021年12月美國基因泰克公司的Jian Payandeh研究組和2022年4月西湖大學的閆湞研究組分別在Nature13和Cell Discovery14雜志上也報道了人源的NALCN-FAM155A-UNC79-UNC80復合體的冷凍電鏡結構。與這些研究相比,本研究觀察到的結構整體相似,并且通過功能實驗闡明了UNC79-UNC80是如何通過促進NALCN上膜以及解除CIH自抑制作用來激活NALCN的,為深入理解NALCN復合體的工作機制奠定了基礎。
本項研究第一作者為陳雷課題組博士后康云路,陳雷為第二作者兼通訊作者。本工作獲得科技部重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金委、北大-清華生命科學聯(lián)合中心等經(jīng)費支持??翟坡帆@得了北京大學博雅博士后獎學金的支持。該工作的冷凍電鏡樣品制備、篩選和采集在北京大學冷凍電鏡平臺上完成,得到了李雪梅、郭振璽、秦昌東、裴霞和王國鵬等人的幫助。該項目的數(shù)據(jù)處理獲得了北京大學CLS計算平臺及未名超算平臺的硬件和技術支持。賓夕法尼亞大學Dejian Ren教授提供了大鼠和人源NALCN,小鼠UNC79和UNC80的cDNA。
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來源:北京大學


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