目前,在中非和西非以外的多個(gè)非流行國(guó)家發(fā)現(xiàn)了許多猴痘病例,并且頻繁發(fā)生人傳人。世界衛(wèi)生組織已于7月23日宣布猴痘為國(guó)際關(guān)注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件(PHEIC)。被忽視的人畜共患病猴痘再次成為全球關(guān)注的焦點(diǎn),中國(guó)為防止猴痘病毒輸入和傳播敲響了警鐘并于2022年7月1日發(fā)布了中國(guó)猴痘防治技術(shù)指南,實(shí)現(xiàn)早發(fā)現(xiàn)、早報(bào)告、早隔離、早治療,進(jìn)一步加強(qiáng)對(duì)來(lái)自流行區(qū)的旅客和移民進(jìn)行癥狀監(jiān)測(cè),控制猴痘病毒人傳人。
9月19日,《中國(guó)疾病預(yù)防控制中心周報(bào)(China CDC Weekly)》公布中國(guó)內(nèi)地首例輸入性猴痘病例相關(guān)信息:一名中國(guó)籍男子在9月14日回國(guó),被重慶市疾控中心確定為猴痘疑似病例。該男子此前曾出現(xiàn)喉嚨干燥發(fā)癢,發(fā)燒,右腳踝出現(xiàn)紅色皮疹和膿皰等癥狀。
內(nèi)地首例!華大智造DNBSEQ-G99助力中國(guó)疾控中心完成重慶輸入性猴痘病例病毒溯源-肽度TIMEDOO內(nèi)地首例!華大智造DNBSEQ-G99助力中國(guó)疾控中心完成重慶輸入性猴痘病例病毒溯源-肽度TIMEDOO

9月16日,采集的該男子的臨床樣本被送往中國(guó)疾病預(yù)防控制中心,進(jìn)行了qPCR檢測(cè),并基于華大智造最新款基因測(cè)序儀DNBSEQ-G99等設(shè)備完成了全基因組測(cè)序。基因測(cè)序結(jié)果表明,該男子所感染的猴痘病毒(China-CQ202209) 屬于西非株的B.1分枝,和重慶疾控中心測(cè)序結(jié)果高度一致,并且與2022年6月21號(hào)在德國(guó)發(fā)現(xiàn)的毒株 (GISAID ID: EPI_ISL_13889435)高度同源。這些結(jié)果確認(rèn)了該病例為中國(guó)內(nèi)地首例輸入性猴痘病例,同時(shí)也是中國(guó)報(bào)道的第5例人感染猴痘病毒病例。其他幾例輸入性人感染猴痘病毒的病例分別報(bào)道于中國(guó)臺(tái)灣和中國(guó)香港特別行政區(qū)。

內(nèi)地首例!華大智造DNBSEQ-G99助力中國(guó)疾控中心完成重慶輸入性猴痘病例病毒溯源-肽度TIMEDOO

值得一提的是,華大智造基于全新技術(shù)打造的最新款基因測(cè)序儀DNBSEQ-G99,助力此次溯源測(cè)序在短時(shí)間內(nèi)得到了高度可信的毒株序列全長(zhǎng)。面對(duì)qPCR檢測(cè)Ct值為21左右的樣本時(shí),三種不同讀長(zhǎng)宏基因組測(cè)序統(tǒng)計(jì)猴痘病毒特異性reads平均約占0.35%。分析結(jié)果顯示在讀長(zhǎng)為SE40時(shí),猴痘病毒基因組平均深度約為35X;SE100時(shí),其平均深度約為110X;PE100時(shí),其平均深度約為200X,100X以上覆蓋度大于99.03%。
內(nèi)地首例!華大智造DNBSEQ-G99助力中國(guó)疾控中心完成重慶輸入性猴痘病例病毒溯源-肽度TIMEDOO內(nèi)地首例!華大智造DNBSEQ-G99助力中國(guó)疾控中心完成重慶輸入性猴痘病例病毒溯源-肽度TIMEDOO

DNBSEQ-G99通過(guò)高密度三角形矩陣的載片、秒級(jí)極速的生化反應(yīng)、緊密排布的流體系統(tǒng)、超高分辨率光學(xué)系統(tǒng)、比PCR儀快2倍的溫控系統(tǒng)等多個(gè)核心系統(tǒng)的集成,實(shí)現(xiàn)了對(duì)測(cè)序效率、質(zhì)量和交付能力的極致提升。同時(shí),DNBSEQ-G99的多時(shí)點(diǎn)數(shù)據(jù)輸出模式(bioanalysis by sequencing, BBS),可進(jìn)一步縮短交付時(shí)間,最快在測(cè)序開(kāi)始后的2.5小時(shí)內(nèi)獲得第一批下機(jī)數(shù)據(jù),在極致快速的基礎(chǔ)上更快一步,且測(cè)序讀長(zhǎng)不受限,更加適用于公衛(wèi)系統(tǒng)緊急多元的檢測(cè)場(chǎng)景。此次猴痘病毒溯源采用的正是DNBSEQ-G99的BBS模式,在實(shí)驗(yàn)全流程第9小時(shí)獲得第一批下機(jī)結(jié)果,助力疾控系統(tǒng)應(yīng)急溯源能力進(jìn)一步提升,更高效地為快速制定相應(yīng)防疫政策提供科學(xué)依據(jù)。

內(nèi)地首例!華大智造DNBSEQ-G99助力中國(guó)疾控中心完成重慶輸入性猴痘病例病毒溯源-肽度TIMEDOO
針對(duì)新發(fā)未知病原體的快速識(shí)別和溯源需求,華大智造基于自主研發(fā)的試劑、儀器和軟件打造了病原微生物高通量測(cè)序產(chǎn)品組合,覆蓋從樣本到報(bào)告輸出全流程,是猴痘病毒識(shí)別和溯源的理想工具。該產(chǎn)品組合可兼容DNBSEQ-G99、DNBSEQ-E25、MGISEQ-200和MGISEQ-2000四款測(cè)序儀, 文庫(kù)制備與數(shù)據(jù)分析均實(shí)現(xiàn)了自動(dòng)化操作。華大智造獨(dú)有的DNBSEQ技術(shù),為病原體的識(shí)別和溯源保障高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
作為全球少數(shù)能自主研發(fā)和量產(chǎn)臨床級(jí)測(cè)序儀的高端制造商之一,華大智造的基因測(cè)序儀、實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化設(shè)備、實(shí)驗(yàn)室管理系統(tǒng)等生命科技核心工具已馳援全球80余個(gè)國(guó)家和地區(qū)的抗擊新冠疫情防控一線(xiàn),全面助力各地疫情防控和病毒溯源,為應(yīng)對(duì)突發(fā)疫情提供強(qiáng)有力的工具支撐。針對(duì)突發(fā)的猴痘疫情,華大智造DNBSEQ-G99可助力在11.5-16小時(shí)*內(nèi)完成猴痘病毒樣本的文庫(kù)制備、測(cè)序和組裝分析全流程。為進(jìn)一步提升猴痘病毒溯源的準(zhǔn)確性,華大智造針對(duì)猴痘病毒基于ATOPlex平臺(tái)定制化設(shè)計(jì)多重PCR panel(ATOPlex MPXV)正在適配更多的毒株,用于猴痘病毒的快速鑒定和溯源。
秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念,在公共衛(wèi)生應(yīng)用領(lǐng)域,華大智造將持續(xù)致力于滿(mǎn)足病原微生物全基因組測(cè)序、靶向測(cè)序和宏基因組測(cè)序全流程等應(yīng)用場(chǎng)景的需求,為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測(cè)和預(yù)警提供更自動(dòng)、更便捷、更高效的國(guó)產(chǎn)化核心工具。