還在認(rèn)為沒有實驗就不能發(fā)表論文？

手頭有很多數(shù)據(jù)，不知道該怎么進一步挖掘？

還在為不知道如何找靶點而苦惱？

還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數(shù)據(jù)庫而痛苦不堪？

還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神？

快來參加北京市計算中心舉辦的生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班吧！

本次培訓(xùn)對目前公共數(shù)據(jù)挖掘熱點進行系統(tǒng)介紹，提供一次系統(tǒng)了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)產(chǎn)生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數(shù)據(jù)庫挖掘多組學(xué)數(shù)據(jù)，以便為自身科研項目服務(wù)。歡迎報名參加。更多消息可關(guān)注“生信會議”公眾號，會給您帶來更多驚喜！

授課對象：

從事生物醫(yī)學(xué)研究的臨床醫(yī)生、轉(zhuǎn)化研究科研人員；

課題經(jīng)費不足，無法進行大規(guī)模測序，但需要發(fā)表SCI論文的相關(guān)研究人員；

已獲得轉(zhuǎn)錄組、基因組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，需要進一步挖掘分析人員；

對生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓(xùn)效果：

短、平、快，為基金申請保駕護航，發(fā)表paper如虎添翼；

掌握多組學(xué)數(shù)據(jù)分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數(shù)據(jù)處理沒有壓力；

科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；

一套數(shù)據(jù)多角度演練，更易掌握分析思路。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位：北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

支持單位：肽度TIMEDOO

云計算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022年12月20-23日 ?上9:30-11:30 下13:30-17:00

時間 主題 內(nèi)容 備注
第一天 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 1、組學(xué)研究概述（基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹）

2、實驗設(shè)計及測序原理

3、生物信息學(xué)背景知識介紹

 理論
公共數(shù)據(jù)庫挖掘熱點介紹 1、人工智能研究在病理切片識別上的應(yīng)用

2、人工智能多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析

 理論
常用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹 1、用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹：

1）大型綜合數(shù)據(jù)庫：NCBI、UCSC

2）公共高通量測序數(shù)據(jù)庫：SRA

3）公共基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫：GEO

4）公共癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)庫：TCGA

2、各大數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)下載

 理論

+演示
第二天 R語言入門 1、R語言簡介

2、R語言安裝及配置

3、R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)

4、R語言數(shù)據(jù)處理

5、R語言繪圖

 理論

+實戰(zhàn)
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（一） 1、差異表達(dá)分析及結(jié)果可視化：

1）edgeR包使用

2）火山圖繪制

3）聚類熱圖繪制

2、GO、KEGG功能富集分析及結(jié)果可視化：

1）GO富集分析

2）KEGG富集分析

3）富集分析氣泡圖繪制

 理論

+實戰(zhàn)
第三天 基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（二） 生存分析及結(jié)果可視化：

1）生存分析、cox模型基本原理介紹

2）模型評估基本原理介紹

3）R語言進行生存分析、生存曲線繪制

4）R語言單變量、多變量cox模型構(gòu)建

5）R語言條件邏輯回歸模型構(gòu)建

6）R語言ROC曲線評估模型

7）HR、OR值計算，模型解釋

 理論

+實戰(zhàn)
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（三） 生物分子網(wǎng)絡(luò)分析及可視化：

1）網(wǎng)絡(luò)簡介

2）網(wǎng)絡(luò)分析（拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析、關(guān)鍵基因識別）

3）生物分子網(wǎng)絡(luò)介紹

4）利用string數(shù)據(jù)庫查詢基因/蛋白相互作用

a.單個基因/蛋白生成相互作用網(wǎng)絡(luò)

b.多個基因/蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析

c.調(diào)研靶標(biāo)信息少時如何拓展

5）利用cytoscape工具構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò)并分析

 理論

+實戰(zhàn)
第四天 多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（一） 1、表觀組高通量數(shù)據(jù)原理

2、甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路

3、表觀組公共數(shù)據(jù)庫：ENCODE、regulomeDB

 理論
1、甲基化數(shù)據(jù)預(yù)處理

2、差異甲基化位點及區(qū)域識別

3、差異分析結(jié)果可視化

 實戰(zhàn)
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（二） lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

1）lncRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)獲取

2）miRNA靶基因分析

3）lncRNA與mRNA表達(dá)相關(guān)性分析

4）ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及結(jié)果可視化

 理論

+實戰(zhàn)

注：內(nèi)容以實際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會提前通知。

【報名費用】

注冊費：4800元/人（含當(dāng)期聽課費、資料費、證書費、考試費（如有））。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團體報名每人可減少300元；

2、4+1團報，可免費贈送一個名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

【付費方式】

手機銀行或電子銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款等

單位全稱：北京市計算中心有限公司

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京自貿(mào)試驗區(qū)永豐基地支行

（匯款信息備注：“智能計算——您的姓名”，個人匯款請備注單位名稱）

注：款項支出后，請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實到賬、開具發(fā)票。

【咨詢請聯(lián)系】

QQ號：659230635

微信號：vicolee2021

【注】開課前一周會發(fā)送郵件通知；若未接到郵件通知，請電話咨詢。