論文投稿幾個(gè)月后,被審稿人打了回來(lái),隨之而來(lái)的是一篇措辭犀利的評(píng)價(jià)。但論文的共同第一作者、中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)副研究員趙歡并不感到氣餒。

“事實(shí)上,論文剛投出去,周斌老師(中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心研究員)就意識(shí)到問(wèn)題了,我們已經(jīng)開(kāi)始著手完善這項(xiàng)工作。”趙歡說(shuō)。

不過(guò),他們沒(méi)有料到,這一完善,就又是3年艱苦攻關(guān)。

科學(xué)家建立新技術(shù)揭示細(xì)胞間相互作用-肽度TIMEDOO

周斌? ? ? ? ?受訪(fǎng)者供圖

12月2日,這篇論文發(fā)表在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》上。該團(tuán)隊(duì)十年磨一劍,開(kāi)發(fā)出可以捕捉體內(nèi)細(xì)胞間相互作用,并能夠永久追蹤?quán)徑?xì)胞的創(chuàng)新研究工具——鄰近細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)。

這項(xiàng)技術(shù)被同行評(píng)價(jià)為“倚天劍”,有望為發(fā)育生物學(xué)、腫瘤學(xué)等眾多領(lǐng)的研究提供一個(gè)強(qiáng)大工具。

生命體內(nèi),細(xì)胞之間如何“交往”?

細(xì)胞之間的相互作用對(duì)生物生長(zhǎng)發(fā)育和器官功能維持至關(guān)重要。但這些精妙的過(guò)程都發(fā)生在復(fù)雜的體內(nèi)環(huán)境中,科學(xué)家很難觀(guān)測(cè)到,更不用說(shuō)開(kāi)展研究了。

2010年,周斌完成哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院的博士后研究工作回國(guó),萌生了開(kāi)展“鄰近細(xì)胞”研究的想法。

就像人一樣,細(xì)胞也會(huì)受到“鄰居”的顯著影響。同樣的細(xì)胞處在不同環(huán)境下,與不同的細(xì)胞群為鄰,形態(tài)結(jié)構(gòu)和生理功能都會(huì)表現(xiàn)出不同特征,甚至它們的命運(yùn)也會(huì)因環(huán)境而變化。

這種奇妙的現(xiàn)象,讓周斌深深著迷。過(guò)去十多年間,他指導(dǎo)學(xué)生進(jìn)行了一系列遺傳示蹤研究,期間取得過(guò)一些進(jìn)展,但那些研究都是利用傳統(tǒng)型遺傳示蹤技術(shù),只能針對(duì)細(xì)胞自身進(jìn)行遺傳操作。這些研究顯然無(wú)法滿(mǎn)足科研人員的求知欲。很多年前,該實(shí)驗(yàn)室就有不少人嘗試在體內(nèi)開(kāi)展對(duì)鄰近細(xì)胞遺傳操作的研究。他們?yōu)榇私⒘艘惶讓?shí)驗(yàn)系統(tǒng),并且進(jìn)行多次優(yōu)化改造。

“但前3年基本都失敗了?!敝鼙笳f(shuō),“直到后來(lái),我們另辟蹊徑,開(kāi)始嘗試將合成生物學(xué)的方法引進(jìn)來(lái)。確切地說(shuō),是人工合成出一條全新的細(xì)胞通路——Synthetic Notch(SynNotch) ,從而把生物體內(nèi)兩個(gè)鄰近細(xì)胞的相互接觸轉(zhuǎn)變?yōu)榭梢匝芯康倪z傳信號(hào)。”

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細(xì)胞遷移改變細(xì)胞互作示意? ? ? ? ?受訪(fǎng)者供圖

十年磨把“倚天劍”

由于周斌長(zhǎng)期從事與心臟發(fā)育相關(guān)的研究,對(duì)心血管系統(tǒng)比較了解,團(tuán)隊(duì)決定以此為切入點(diǎn)開(kāi)展研究。他們把心臟中心肌細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞作為主要研究對(duì)象,將心肌細(xì)胞作為SynNotch信號(hào)發(fā)送細(xì)胞,內(nèi)皮細(xì)胞作為SynNotch信號(hào)接收細(xì)胞,分別構(gòu)建了相關(guān)的工具小鼠。

這是一種非常精巧的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。當(dāng)心肌細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞接觸或分開(kāi)時(shí),會(huì)產(chǎn)生不同的遺傳信號(hào)表現(xiàn),從而反映細(xì)胞之間的實(shí)時(shí)接觸信息。

2018年,團(tuán)隊(duì)里的博士后張少華(本文共同第一作者)用實(shí)驗(yàn)初步驗(yàn)證了體內(nèi)進(jìn)行鄰近細(xì)胞遺傳操作的可行性。這個(gè)重大突破,一時(shí)間讓大家“群情激昂”。

接下來(lái),他們又進(jìn)一步完善了這個(gè)系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了永久性的示蹤標(biāo)記。

通過(guò)這套技術(shù),他們發(fā)現(xiàn)了很多有趣的生命現(xiàn)象:心臟內(nèi)皮細(xì)胞會(huì)在胚胎發(fā)育過(guò)程中遷移到肝臟,轉(zhuǎn)變成為肝臟特有的肝血竇內(nèi)皮細(xì)胞,對(duì)維持肝臟的正常功能可能具有重要作用。

在腫瘤發(fā)生過(guò)程中,腫瘤血管內(nèi)皮細(xì)胞會(huì)遷移到腫瘤外包膜。這部分遷移到腫瘤外包膜的血管內(nèi)皮細(xì)胞仍然具有典型的轉(zhuǎn)移和浸潤(rùn)、促血管生成以及炎癥反應(yīng)等特征,說(shuō)明細(xì)胞進(jìn)入新環(huán)境后,最初環(huán)境賦予細(xì)胞的影響可能仍然存在。

“這些結(jié)果,展示了體內(nèi)細(xì)胞令人驚嘆的互作過(guò)程?!敝鼙笳f(shuō),“這也提示我們,細(xì)胞間的相互作用有著很大的應(yīng)用前景。比如對(duì)某個(gè)細(xì)胞進(jìn)行改造,然后植入體內(nèi),讓影響它周?chē)?xì)胞,從而達(dá)到基因改造或疾病治療的目標(biāo)。又比如,弄清腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程中與其他器官細(xì)胞的相互作用規(guī)律,就有可能開(kāi)發(fā)出干預(yù)手段,阻斷癌癥的轉(zhuǎn)移?!?/p>

都說(shuō)“十年磨一劍”。在中科院分子細(xì)胞卓越中心主任劉小龍看來(lái),周斌這是磨了一把“倚天劍”,未來(lái)有望解決更多復(fù)雜的生命科學(xué)問(wèn)題。

中國(guó)科學(xué)院院士李林則說(shuō):“許多重要的科學(xué)發(fā)現(xiàn),往往得益于關(guān)鍵技術(shù)的創(chuàng)新。周斌團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的這種工具鼠,對(duì)生命現(xiàn)象做出的‘實(shí)時(shí)、定量、動(dòng)態(tài)、原位’的描述,是非常值得期待的。”

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相關(guān)研究在《科學(xué)》發(fā)表???? ? ?受訪(fǎng)者供圖

3年“補(bǔ)稿”交出完美答卷

但這樣一項(xiàng)令人驚喜的工作,投稿過(guò)程卻并不順利。

2020年,團(tuán)隊(duì)第一次將論文投到《科學(xué)》。幾個(gè)月后,稿件被退回,其中一位審稿人提出了“尖銳意見(jiàn)”,直言“并不看好這一‘工具’,因?yàn)閼?yīng)用范圍太窄,只是針對(duì)心血管進(jìn)行的實(shí)驗(yàn),真正能使用該技術(shù)的人很少”。

對(duì)這樣的反饋,大家卻并不意外。他們也希望自己開(kāi)發(fā)的系統(tǒng)能應(yīng)用在更多的器官和組織中,發(fā)揮更強(qiáng)大的作用。

“一開(kāi)始我們覺(jué)得補(bǔ)充實(shí)驗(yàn)和改造系統(tǒng)難度不會(huì)太大?!壁w歡說(shuō),“但事實(shí)和我們想象得并不一樣?!?/p>

在不同的生物組織中,不同的基因表達(dá)水平不同,其配體、受體的強(qiáng)弱也不相同,這意味著系統(tǒng)的升級(jí)絕不是簡(jiǎn)單的“打補(bǔ)丁”、改條件,很多時(shí)候甚至需要放棄一些以前建立的系統(tǒng),從頭再來(lái)。

為此,他們進(jìn)一步擴(kuò)大了團(tuán)隊(duì)合作的范圍,與美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校Rong A. Wang教授、西湖大學(xué)研究員何靈娟等人合作,經(jīng)過(guò)3年打磨,終于構(gòu)建出一套具有廣泛適用性的系統(tǒng)。

這個(gè)系統(tǒng)在小鼠身上,可以實(shí)現(xiàn)標(biāo)記任意類(lèi)型細(xì)胞,并利用該細(xì)胞,讓周?chē)蓄?lèi)型的細(xì)胞產(chǎn)生響應(yīng)。

“這篇文章的工作量讓人贊嘆。我很滿(mǎn)意作者的修改數(shù)據(jù)?!惫Ψ虿回?fù)有心人,3年的補(bǔ)稿工作得到論文評(píng)審人的高度認(rèn)同。審稿人認(rèn)為,作者完成了大量的實(shí)驗(yàn)工作,展示了該技術(shù)的可靠性,適用于眾多生物學(xué)領(lǐng)域。

未參與這項(xiàng)研究的國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心研究員楊曉也對(duì)這項(xiàng)成果的廣泛適用性很感興趣:“它為深入探求體內(nèi)細(xì)胞命運(yùn)可塑性提供了重要的技術(shù)手段,有望應(yīng)用于研究微環(huán)境細(xì)胞對(duì)干細(xì)胞的影響、免疫細(xì)胞的相互作用、神經(jīng)元接觸、癌細(xì)胞之間及其與鄰近免疫細(xì)胞之間的影響,也能為疾病治療提供全新策略?!?/p>

相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1126/science.abo5503

來(lái)源:《科學(xué)》、《中國(guó)科學(xué)報(bào)》