研究實(shí)現(xiàn)多種呼吸道病毒精準(zhǔn)檢測(cè)
10月1日,中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院生物醫(yī)學(xué)與健康工程研究所研究員楊慧團(tuán)隊(duì),與深圳市兒童醫(yī)院麻曉鵬、謝中建團(tuán)隊(duì)合作,在《生物傳感器與生物電子學(xué)》上發(fā)表最新研究進(jìn)展。該研究開(kāi)發(fā)了一種基于CRISPR/Cas12a和等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LOC-CRISPR)的簡(jiǎn)單、全封閉、高度集成的微流控系統(tǒng),可以特異性識(shí)別多種常見(jiàn)呼吸道病毒及其變種。
呼吸道病毒是導(dǎo)致呼吸道感染的主要因素之一,包括冠狀病毒、流感病毒和呼吸道合胞病毒等。在兒童和老年人等高風(fēng)險(xiǎn)人群中,病毒感染導(dǎo)致的死亡率極高。傳統(tǒng)的診斷方法通常需要復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)設(shè)備和較長(zhǎng)的檢測(cè)周期,且存在著高成本、低靈敏度等問(wèn)題。此外,傳統(tǒng)的PCR技術(shù)只能確定病毒類型,如果要檢測(cè)同一病毒的不同變異株,就需要進(jìn)行昂貴且耗時(shí)的基因測(cè)序。
為了解決上述問(wèn)題,研究人員開(kāi)發(fā)了一種名為L(zhǎng)OC-CRISPR的新技術(shù),它基于CRISPR/Cas12a和等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),是一種簡(jiǎn)單、全封閉、高度集成的微流控系統(tǒng)。該系統(tǒng)可以對(duì)SARS-CoV-2(新冠病毒)及其變異株、H1N1(甲型流感病毒)、H3N2(甲型流感病毒)、IVB(流感病毒)和HRSV(呼吸道感染病毒)的進(jìn)行精準(zhǔn)識(shí)別。在臨床樣本測(cè)試中,研究團(tuán)隊(duì)使用LOC-CRISPR芯片分析了50份鼻咽拭子樣本(44份陽(yáng)性和6份陰性),并獲得了優(yōu)異的靈敏度(97.8%)和特異性(100%)。
該系統(tǒng)中,研究人員在LOC-CRISPR芯片中集成了核酸提取、核酸擴(kuò)增和熒光檢測(cè)三個(gè)功能區(qū)。并且LOC-CRISPR芯片還設(shè)計(jì)了用于多重檢測(cè)(兩個(gè)樣本輸入和十個(gè)結(jié)果輸出)需求的特殊結(jié)構(gòu)。該系統(tǒng)中的另一項(xiàng)關(guān)鍵技術(shù)是CRISPR/Cas12a技術(shù),它是一種基于RNA導(dǎo)向的基因編輯技術(shù),能夠通過(guò)特異性識(shí)別和切割DNA序列,具有高度特異性和高效率的特點(diǎn)。研究團(tuán)隊(duì)利用CRISPR/Cas12a的導(dǎo)向作用,將其與等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)相結(jié)合,減少檢測(cè)步驟,降低檢測(cè)時(shí)間,不僅實(shí)現(xiàn)了呼吸道病毒的種類識(shí)別,而且還實(shí)現(xiàn)了對(duì)新型冠狀病毒的不同變異株之間的堿基序列識(shí)別。
該研究有望實(shí)現(xiàn)將實(shí)驗(yàn)室科學(xué)帶入社區(qū)診所,是診斷技術(shù)領(lǐng)域的一個(gè)重大突破。未來(lái),隨著針對(duì)多種疾病診斷試劑的持續(xù)開(kāi)發(fā),該款微流控芯片將在疾病預(yù)防、健康監(jiān)測(cè)以及個(gè)性化醫(yī)療方面,具有巨大的潛力和應(yīng)用價(jià)值。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.bios.2023.115523
來(lái)源:中國(guó)科學(xué)報(bào)


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