馬薩諸塞大學(xué)阿默斯特分校研究團隊獲NIH撥款,利用深度學(xué)習(xí)開發(fā)阿爾茨海默病早期預(yù)測模型-肽度TIMEDOO

馬薩諸塞大學(xué)阿默斯特分校的研究人員獲得了一項為期兩年、總額為278,118美元的國立衛(wèi)生研究院(NIH)撥款,用于開發(fā)利用臨床數(shù)據(jù)(包括在實際情境中獲取的腦部MRI圖像)進行早期預(yù)測阿爾茨海默病的新型深度學(xué)習(xí)模型。

該研究的最終目標(biāo)是通過MRI數(shù)據(jù)實現(xiàn)對阿爾茨海默病的更早期檢測,理想情況下是在癥狀發(fā)作前兩年或更長時間,同時識別處于患病風(fēng)險的患者群體,以便研究人員可以測試中斷疾病進程的干預(yù)措施和藥物。為了創(chuàng)建這些預(yù)測模型,研究人員將使用多模式臨床數(shù)據(jù),包括腦部MRI圖像。

馬薩諸塞大學(xué)信息與計算機科學(xué)學(xué)院的助理教授兼研究項目負(fù)責(zé)人Madalina(Ina)Fiterau博士表示:“這項研究使我們更接近將人們放入臨床試驗的時機,那時大腦生物學(xué)仍然完好,并且可以采取措施?!彼赋觯骸霸谠\斷時,患者的大腦物質(zhì)已經(jīng)減少60%,而在那個階段已經(jīng)無法挽回。我們希望能夠盡早發(fā)現(xiàn)這些變化,至少在發(fā)病前兩年,然后根據(jù)這一發(fā)現(xiàn)確定哪些治療方法有效?!?/p>

馬薩諸塞大學(xué)阿默斯特分校研究團隊獲NIH撥款,利用深度學(xué)習(xí)開發(fā)阿爾茨海默病早期預(yù)測模型-肽度TIMEDOO

研究的另一位主要研究者Joyita Dutta博士,生物醫(yī)學(xué)工程副教授,表示:“三年前我們可能無法說到這一步,但現(xiàn)在許多新的藥物候選品正在涌現(xiàn),我們正處于可以使用預(yù)測技術(shù)來識別潛在受試者以進行疾病修飾療法的階段?!?/p>

之前的研究旨在使用阿爾茨海默病神經(jīng)影像學(xué)倡議(ADNI)的數(shù)據(jù)創(chuàng)建用于預(yù)測退行性疾病的深度學(xué)習(xí)模型。然而,這對于使研究結(jié)果具有普遍適用性構(gòu)成了挑戰(zhàn),因為這些基于ADNI的模型使用經(jīng)過工程處理的數(shù)據(jù)。例如,其他研究使用軟件提取平均皮層厚度,而不是包含實際大腦皮層圖像。

Fiterau解釋說:“ADNI包含從大腦圖像中提取的大量專業(yè)特征,這需要大量的特征工程和領(lǐng)域?qū)I(yè)知識?!彼f:“在野外收集的數(shù)據(jù)不會具有這些專業(yè)特征。你將擁有MRI掃描,但沒有注釋?!彼赋觯骸斑@項撥款的目的是弄清楚如何將在專業(yè)精心策劃的數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練的模型應(yīng)用于在野外收集的真實數(shù)據(jù),以及在這種情況下模型的性能如何?!?/p>

馬薩諸塞大學(xué)阿默斯特分校研究團隊獲NIH撥款,利用深度學(xué)習(xí)開發(fā)阿爾茨海默病早期預(yù)測模型-肽度TIMEDOO

這項研究的重要性在于它使預(yù)測算法能夠使用標(biāo)準(zhǔn)MRI而不需要專業(yè)數(shù)據(jù),Dutta指出:“我在我的研究中廣泛使用PET掃描,但并非每個診所都收集阿爾茨海默病患者的PET圖像?!彼f:“同時,MRI往往是神經(jīng)癥狀患者的首選成像模式。然而,臨床可用的MRI掃描通常是使用不同于ADNI的協(xié)議進行的。因此,預(yù)測模型需要對‘野外收集的數(shù)據(jù)’具有普遍適用性,以便在實際中發(fā)揮作用?!?/p>

研究團隊將使用深度學(xué)習(xí)從標(biāo)準(zhǔn)腦部MRI中提取特征,這些特征可以代替ADNI數(shù)據(jù)集中的專業(yè)特征。研究人員知道阿爾茨海默病影響的一些關(guān)鍵區(qū)域,如海馬體、大腦皮層和充滿液體的腦室腔,因此模型將被訓(xùn)練在這些區(qū)域上賦予更高的權(quán)重。

該研究還旨在克服ADNI數(shù)據(jù)中存在的模型偏見,即少數(shù)族裔的代表不足和高度受教育者的過度代表。在該數(shù)據(jù)集中,93%的參與者是白人,61%的受教育程度為16年或更多(美國平均為14年)。

編輯:周敏

排版:李麗