研究發(fā)現(xiàn)與帕金森病相關(guān)的結(jié)構(gòu)、拷貝數(shù)變異
帕金森?。≒D)是一種常見的老年神經(jīng)退行性疾病。近年來國內(nèi)外大樣本全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)等研究發(fā)現(xiàn)了系列與PD相關(guān)的單核苷酸變異(SNP),但基因組上的結(jié)構(gòu)變異、拷貝數(shù)變異和短串聯(lián)重復(fù)變異與PD的關(guān)系仍不明確。
近日,首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科教授王朝東、陳彪聯(lián)合華大基因研究院張建國研究員和劉漢奎助理研究員在npj Parkinson’s diseas期刊發(fā)表研究首次通過高深度全基因組測序,聯(lián)合長讀長、Sanger測序和定量PCR(qPCR)等技術(shù)確認(rèn)了MUC19基因上1.6kb缺失變異、RXFP1基因上的12.4kb拷貝數(shù)變異和SLC2A13基因上的GGGAAA重復(fù)數(shù)目與帕金森病顯著相關(guān)。
同時,研究還發(fā)現(xiàn)SLC2A13和MUC19基因分別位于LRRK2基因的上下游,5拷貝的GGGAAA重復(fù)單元擴增和缺失型MUC19結(jié)構(gòu)變異顯著降低了LRRK2 G2385R(最常見的東亞人群帕金森病相關(guān)變異)的發(fā)病風(fēng)險。這一發(fā)現(xiàn)首次為G2385R找到了遺傳修飾因素,也為其臨床上表現(xiàn)的相對低外顯率提供了解釋。
此外,研究團隊還發(fā)現(xiàn),人類染色體兩端5Mb的區(qū)間內(nèi)帕金森患者的拷貝數(shù)變異負(fù)荷顯著更高。而且隨著年齡的增長,健康對照的染色體末端CNV負(fù)荷也隨之升高,提示了染色體端粒變異、衰老和帕金森病的關(guān)系。
據(jù)悉,王朝東、劉漢奎為共同第一作者,陳彪、張建國為共同通訊作者。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41531-024-00722-1
來源:中國科學(xué)報


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