一個供研究人員共享危險病毒基因組的新數據庫，有望解決許多阻礙現有方法的問題。但前提是，必須說服研究人員使用它。

據《自然》報道，這一名為Pathoplexus的數據庫于上個月啟動，數據庫背后的科學家團隊希望有更多研究人員分享已知和新出現的對公共衛(wèi)生具有重要意義的基因序列。

澳大利亞悉尼大學病毒學家Edward Holmes說，盡可能快地共享序列對于識別新病毒、跟蹤其變異至關重要，同時也有助于疫苗設計。

Pathoplexus數據庫目前聚焦其他數據庫未包含的4種病毒：克里米亞-剛果出血熱病毒、蘇丹埃博拉病毒、扎伊爾埃博拉病毒和西尼羅河病毒。該團隊表示，稍后還會在數據庫中添加其他病原體。

現有最大的數據庫之一是美國的GenBank，它允許無限制訪問。但是無限制訪問意味著理論上任何人都可以使用這些數據發(fā)表科學論文，而無需承認數據所有者。這阻礙了科學家，特別是來自低收入國家的科學家在突發(fā)公共衛(wèi)生事件期間快速分享他們的數據。

另一個數據庫GISAID要求用戶注冊，同意承認數據所有者并盡力與所有者合作，旨在確保數據提交者的權利。GISAID一度非常受歡迎，但研究人員對其治理透明度、如何調解關于誠信的爭議等提出了擔憂。

日本東京大學進化病毒學家Spyros Lytras說：“在過去幾年里，GISAID遇到了很多挫折?！钡茖W界也吸取了教訓。“從零開始是我們所需要的，Pathoplexus數據庫可能是解決方案?！?/p>

Pathoplexus數據庫為用戶提供了一些保護。例如，研究人員可以對他人如何使用他們的數據進行限制，例如，不允許在沒有明確許可的情況下，在一年內將他們的數據作為科學出版物的重點。這應該為數據所有者留足了時間來提交他們的研究成果初稿。

用戶還必須在他們的出版物中注明數據所有者?！拔覀兊哪繕耸墙⒁粋€社區(qū)，讓研究人員確信他們的貢獻將得到尊重和適當認可?！盤athoplexus數據庫團隊成員、全球基因組流行病學公共衛(wèi)生聯盟運營負責人Jamie Southgate說。

Pathoplexus不會阻止違反使用條款的個人訪問該網站，而GISAID在極少數情況下會這樣做。相反，如果發(fā)布的數據違反了條款，該團隊將聯系期刊，確保數據按照共享方式使用。Pathoplexus數據庫的聯合創(chuàng)始人、瑞士熱帶和公共衛(wèi)生研究所分子流行病學家Emma Hodcroft說：“我們盡力讓條款十分明確。”

孟加拉兒童健康研究基金會分子微生物學家Senjuti Saha同意聯系出版商的方法。“這是一個很好的、聰明的解決方案?！彼J為，Pathoplexus數據庫的透明度將在科學界中建立信任。

Saha強調，現在說Pathoplexus存儲庫能否解決當前的數據共享問題還為時過早?！暗@是非常棒的第一步?！?/p>

Pathoplexus的創(chuàng)建者盡力改進用戶體驗，例如盡可能簡化上傳過程。Pathoplexus數據庫還會檢查序列數據和相關信息的錯誤，并幫助將病毒組織成亞型。

目前，已經有數千人訪問了該數據庫，有50人創(chuàng)建了賬戶提交數據，但沒有人提交序列。為了擴大規(guī)模，Pathoplexus數據庫團隊需要獲得長期資金。Hodcroft說，現在的首要任務是吸引捐助者，“我抱著謹慎的希望”。

來源：中國科學報