從西湖大學(xué)獲悉,該校未來產(chǎn)業(yè)研究中心、生命科學(xué)學(xué)院、西湖實驗室盧培龍課題組首次實現(xiàn)跨膜熒光激活蛋白的從頭設(shè)計,這也是首個通過人工設(shè)計得到的、能夠精確結(jié)合特定小分子的跨膜蛋白。相關(guān)研究成果當(dāng)天在線發(fā)表于《自然》雜志。

跨膜蛋白承擔(dān)著細胞內(nèi)外物質(zhì)交換與信息傳遞的重任?!叭祟惢蚪M中,超過四分之一的蛋白質(zhì)為膜蛋白,人體的視覺、聽覺、觸覺、味覺和嗅覺均依賴其發(fā)揮作用?!北R培龍介紹,目前世界上約一半的現(xiàn)代藥物都以膜蛋白為靶標分子。在此背景下,人工設(shè)計膜蛋白成為極具價值的研究方向。

科學(xué)家首次實現(xiàn)跨膜熒光激活蛋白從頭設(shè)計-肽度TIMEDOO

從頭設(shè)計跨膜熒光激活蛋白模型。西湖大學(xué)供圖。

該項研究于2019年開啟,旨在從頭設(shè)計一種能夠特異性地結(jié)合某種小分子的跨膜蛋白。課題組選定名叫HBC599的熒光基團作為結(jié)合目標。這種熒光基團在游離狀態(tài)下不發(fā)光,只有當(dāng)以特定姿態(tài)被穩(wěn)定結(jié)合,才發(fā)出熒光。

研究過程困難重重?!耙驗樾》肿咏Y(jié)合蛋白對精度的要求極高,成功的設(shè)計與失敗的設(shè)計之間,有時只有0.1納米的偏差?!闭n題組成員、論文第一作者朱璟熠說。

研究人員耗時3年不斷進行實驗,終于成功構(gòu)建出能與HBC599熒光基團強力結(jié)合的結(jié)構(gòu),其熒光亮度是這種熒光基團游離狀態(tài)的上千倍。此后,研究團隊又花費1年時間,調(diào)整蛋白表面性質(zhì),成功獲得“跨膜”版本的熒光激活蛋白,其熒光亮度提升至熒光基團游離狀態(tài)的1600倍。

在此基礎(chǔ)上,課題組試圖對跨膜蛋白實驗結(jié)構(gòu)進行解析,以證明其和設(shè)計模型是一致的。由于蛋白過小,超出冷凍電鏡解析極限,解析工作面臨巨大挑戰(zhàn)。不過,盧培龍憑借此前積累的經(jīng)驗,想到通過蛋白質(zhì)設(shè)計方法將蛋白變大的創(chuàng)新思路。經(jīng)過努力,課題組終于成功解析出設(shè)計蛋白與熒光基團復(fù)合物的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu),證實其與設(shè)計模型高度一致。

“首次實現(xiàn)跨膜熒光激活蛋白從頭設(shè)計,為后續(xù)膜蛋白設(shè)計研究提供了寶貴經(jīng)驗和方法?!北R培龍表示,這項科研成果在膜成像、跨膜傳感器、跨膜物質(zhì)傳輸?shù)阮I(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。

來源:科技日報