歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目，本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻28篇，下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進展。

1、?來自胃癌外泌體的circRNA通過靶向miR-133/PRDM16途徑促進白色脂肪褐變

文獻標題：Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway

期刊：Int J Cancer. 影響因子：7.36

通訊作者單位：天津醫(yī)科大學腫瘤醫(yī)院

癌癥相關的惡病質是一種代謝綜合征，其特征在于脂肪和骨骼肌的消耗紊亂，并伴有體重減輕和全身性炎癥。癌癥惡病質的治療選擇是有限的，并且分子機制仍然知之甚少。環(huán)狀RNA（circRNA）是一種新的內源性RNA家族，已被發(fā)現廣泛參與調節(jié)哺乳動物的基因表達。外泌體是源自細胞的小囊泡，并且最近的研究表明circRNA在外泌體中穩(wěn)定存在。然而，關于circRNA在外泌體中的生物學作用知之甚少。在這項研究中，我們發(fā)現在胃癌（GC）血漿外泌體中的circRNAs具有特異性表達特征，并且ciRS-133與GC患者中白色脂肪組織（WAT）的褐變相關。源自GC細胞的外泌體將ciRS-133遞送到前脂肪細胞中，通過激活PRDM16和抑制miR-133促進前脂肪細胞分化成棕色樣細胞。此外，ciRS-133的敲低減少了腫瘤移植小鼠的癌癥惡病質，減少了氧氣消耗和產熱。因此，外泌體遞送的circRNA參與WAT褐變并在癌癥相關的惡病質中起關鍵作用。

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圖注：A:電鏡檢測分離自人血漿外泌體；B：NTA納米顆粒示蹤儀分析外泌體粒徑；C：Western blot分析外泌體表面標志物；D:circRNA芯片初步篩查胃癌血漿來源外泌體中的circRNAs；E:RT-qPCR驗證ciRS-133在胃癌血漿中顯著高表達。

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圖注：F：相對于癌旁組織，ciRS-133在胃癌組織中顯著高表達；G：生信預測發(fā)現ciRS-133上存在2個miR-133結合位點；H:ciRS-133與褐色脂肪組織（BAT）質量正相關；I：ciRS-133與個體脂肪比率負相關。

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2 一種新的環(huán)狀RNA circFAT1(e2)通過靶向細胞質中的miR-548g并與細胞核中的YBX1相互作用來抑制胃癌的進展

文獻標題：A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus

期刊：Cancer Lett. 影響因子：6.494

通訊作者單位：蘇州大學第一附屬醫(yī)院

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在本研究中，研究者通過分析挖掘GEO數據庫中胃癌(GC)組織環(huán)狀RNA (circRNA)表達譜。發(fā)現一個新的circRNA, has_circ_0001461，我們稱之為circFAT1(e2)并進一步證實circFAT1(e2)在胃癌組織和細胞系中顯著下調，并與胃癌患者的總體生存率相關。熒光原位雜交(FISH)分析顯示circFAT1(e2)分布在GC細胞的細胞質中，也可分布在細胞核中。功能實驗表明，circFAT1(e2)的過表達抑制了GC細胞的增殖、遷移和侵襲。然后，我們研究circFAT1(e2)是否作為microRNA-549g(miR-548g)的海綿并調控腫瘤抑制因子RUNX1在GC細胞中的表達。此外，我們發(fā)現位于核的circFAT1(e2)可以直接與Y-box結合蛋白-1 (YBX1)相互作用并抑制其功能。綜上所述，circFAT1(e2)可能通過調節(jié)細胞質中的miR-548g/RUNX1軸，靶向細胞核中的YBX1，在GC細胞中發(fā)揮抑癌作用。

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圖注：A：通過生物信息學技術挖掘GEO中胃癌中差異表達的circRNA表達譜并繪制聚類熱圖；B：兩個GEO數據集中存在兩個重疊的circRNA（GSE100170和?GSE83521）；C: circFAT1(e2)基因組定位示意圖；

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圖注：D:RT-PCR在gDNA和cDNA中驗證circFAT1(e2)的表達；E:sanger測序驗證circFAT1(e2)的反向拼接位點序列；F：RT-PCR檢測circFAT1(e2)和linFAT1在放線菌D處理MGC803細胞中的表達情況；G：RT-PCR檢測circFAT1(e2)和linFAT1在RNase R處理MGC803細胞中的表達情況；

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3、?環(huán)狀RNA表達譜鑒定前列腺癌特異性環(huán)狀RNA

文獻標題：Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer

期刊：Cell Physiol Biochem. 影響因子：5.5

通訊作者單位：上海復旦大學

前列腺癌(PCa)是嚴重損害男性健康的主要癌癥之一，發(fā)病率和死亡率均較高，但目前對于前列腺癌的診斷和預后尚無理想的分子標志物。該研究采用ceRNA芯片在4對前列腺癌及癌旁組織中篩選差異表達環(huán)狀RNA，以確定其是否可作為前列腺癌診斷的新生物標志物。利用Cytoscape軟件構建了circRNA-miRNA-mRNA的差異環(huán)狀RNA及其宿主基因調控網絡。通過qRT-PCR技術驗證微陣列數據。結果表明我們在PCa腫瘤中發(fā)現了1021個差異表達的環(huán)狀RNA，并通過qRT-PCR分析證實了circ_0057558、circ_0062019和SLC19A1在PCa細胞系和腫瘤組織中的表達。我們發(fā)現，PSA水平與兩種差異表達的環(huán)狀RNA聯(lián)合使用后，診斷性能AUC靈敏度和特異性(分別為0.938、84.5%和90.9%)均明顯高于單獨使用PSA(血清PSA的AUC為0.854)。此外，circ_0057558與總膽固醇呈正相關。circRNA-miRNA-mRNA分析的功能網絡顯示circ_0057558和circ_0034467調控了miR-6884, circ_0062019和circ_0060325調控了miR-5008。研究結果表明，circ_0062019和circ_0057558兩個差異表達環(huán)狀RNA和circ_0062019的宿主基因SLC19A1可作為前列腺癌潛在的新型生物標志物。

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圖注： circRNA芯片的散點圖和聚類熱圖展示了circRNA和mRNA在前列腺癌組織和正常組織中的差異表達情況

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圖注：前列腺癌中差異表達circRNA的宿主基因gene ontology富集分析結果（前30個term）

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表2:生物信息學預測4個差異表達的circRNA可能結合的miRNAs

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圖注：三個circRNA分子（circ_0057558, circ_0062019, circ_0075538）和SLC19A1在前列腺癌和癌旁組織中的差異表達情況（采用qRT-PCR技術檢測）

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參考文獻列表

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序號 主要內容 文獻標題 期刊

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 單位
1 源自胃腫瘤的外泌體circRNA通過靶向miR-133/PRDM16途徑促進白色脂肪褐變 Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway Int J Cancer. 7.36 天津醫(yī)科大學腫瘤醫(yī)院
2 一種新的環(huán)狀RNA circFAT1(e2)通過靶向細胞質中的miR-548g并與細胞核中的YBX1相互作用來抑制胃癌的進展 A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus Cancer Lett. 6.494 蘇州大學第一附屬醫(yī)院
3 環(huán)狀RNA表達譜鑒定前列腺癌特異性環(huán)狀RNA Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer Cell Physiol Biochem. 5.5 上海復旦大學
4 ER陽性亞型乳腺癌關鍵差異表達環(huán)狀rna的鑒定與綜合分析 Identification and integrated analysis of key differentially expressed circular RNAs in ER-positive subtype breast cancer Epigenomics. 4.979 上海仁濟醫(yī)院
5 RPAD（RNase R處理，聚腺苷酸化和poly（A）+RNA去除）方法分離高純環(huán)狀RNA RPAD (RNase R treatment, polyadenylation, and poly(A)+ RNA depletion) method to isolate highly pure circular RNA Methods. 3.998 美國國立衛(wèi)生研究院
6 環(huán)狀RNA在機械力處理人牙周韌帶干細胞(PDLSCs)過程的表達特征 Identification and characterization of circular RNAs involved in mechanical force-induced periodontal ligament stem cells J Cell Physiol. 3.923 山東大學口腔醫(yī)學院
7 CircRNA circPDSS1通過海綿狀吸附miR-186-5p和調節(jié)NEK2促進胃癌進展 CircRNA circPDSS1 promotes the gastric cancer progression by sponging miR-186-5p and modulating NEK2 J Cell Physiol. 3.923 云南省第一人民醫(yī)院
8 Hsa_circ_0136666通過miR-136/SH2B1軸促進結直腸癌的增殖和侵襲 Hsa_circ_0136666 promotes the proliferation and invasion of colorectal cancer through miR-136/SH2B1 axis J Cell Physiol. 3.923 河南科技大學附屬第一醫(yī)院
9 早期妊娠小鼠著床部位和著床間部位環(huán)狀rna表達模式的改變 Altered expression patterns of circular RNAs between implantation sites and interimplantation sites in early pregnant mice J Cell Physiol. 3.923 重慶醫(yī)科大學
10 肌肉功能和疾病中的環(huán)狀RNA研究進展Circular RNAs in Muscle Function and Disease. ? Int J Mol Sci. 3.687 圣多納托米拉內塞
11 PWCDA:預測環(huán)狀rna -疾病關聯(lián)的路徑加權方法 PWCDA: Path Weighted Method for Predicting circRNA-Disease Associations Int J Mol Sci. 3.687 陜西師范大學
12 circRNA circ_0001721上調可預測骨肉瘤的不良預后，并通過海綿樣吸附miR-569和miR-599促進細胞惡化進展 Upregulation of circular RNA circ_0001721 predicts unfavorable prognosis in osteosarcoma and facilitates cell progression via sponging miR-569 and miR-599 Biomed Pharmacother. 3.457 牡丹江醫(yī)學院
13 肝組織中環(huán)狀rna在肝纖維化模型中的差異表達及其靶基因功能分析 Differential expression of circular RNAs in hepatic tissue in a model of liver fibrosis and functional analysis of theirtarget genes Hepatol Res. 3.415 寧波大學醫(yī)學院
14 環(huán)狀RNA在肺癌中的研究進展 Research progress of circular RNAs in lung cancer Cancer Biol Ther. 3.373 中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院
15 人乳頭瘤病毒16e7癌蛋白改變了Caski細胞中環(huán)狀rna的表達譜 Human papillomavirus 16 E7 oncoprotein alters the expression profiles of circular RNAs in Caski cells J Cancer. 3.249 南方醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院
16 Circ_0027599/PHDLA1通過吸附miR-101-3p.1抑制胃癌進展 Circ_0027599/PHDLA1 suppresses gastric cancer progression by sponging miR-101-3p.1 Cell Biosci. 3.219 上海市第六人民醫(yī)院
17 豬皮下脂肪形成過程中mrna、lncrna和環(huán)狀rna的全基因組表達譜研究 A genome-wide landscape of mRNAs, lncRNAs, and circRNAs during subcutaneous adipogenesis in pigs J Anim Sci Biotechnol. 3.205 南京農業(yè)大學
18 WebCircRNA:對編碼和非編碼RNA的環(huán)狀RNA潛力進行分類數據庫 WebCircRNA: Classifying the Circular RNA Potential of Coding and Noncoding RNA Genes (Basel). 3.191 哥本哈根大學
19 CircABCB10通過調節(jié)miR-1252/FOXR2軸促進非小細胞肺癌細胞增殖和遷移 CircABCB10 promotes nonsmall cell lung cancer cell proliferation and migration by regulating the miR-1252/FOXR2 axis J Cell Biochem. 2.959 上海同濟大學第十人民醫(yī)院
20 上調環(huán)狀RNA circ_0007534提示胰腺導管腺癌預后不良，可通過海綿樣吸附miR-625和miR-892b調節(jié)細胞增殖、凋亡和侵襲 Upregulated circular RNA circ_0007534 indicates an unfavorable prognosis in pancreatic ductal adenocarcinoma and regulates cell proliferation, apoptosis, and invasion by sponging miR-625 and miR-892b J Cell Biochem. 2.959 齊齊哈爾醫(yī)科大學附屬第三醫(yī)院
21 CircPAN3通過miR-153-5p/miR-183-5p-XIAP軸介導急性髓系白血病的耐藥性 CircPAN3 mediates drug resistance in acute myeloid leukemia through the miR-153-5p/miR-183-5p-XIAP axis Exp Hematol. 2.436 福建醫(yī)科大學
22 同型半胱氨酸處理后人視網膜細胞中環(huán)狀RNA分子的表達分析 Expression Analysis of the Circular RNA Molecules in the Human Retinal Cells Treated with Homocysteine. Curr Eye Res. 2.12 路易斯維爾大學醫(yī)學院
23 circCOL3A1-859267通過海綿樣吸附miR-29c在人真皮成纖維細胞中調節(jié)I型膠原表達 ? Eur J Dermatol. 1.944 中山大學附屬第三醫(yī)院
24 環(huán)狀RNA作為新的生物標志物和癌癥治療靶點研究進展綜述 Circular RNAs Serve as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Cancers Curr Gene Ther. 1.943 寧波大學醫(yī)學院
25 內源性mirna海綿介導了非編碼RNA網絡振蕩動力學的產生 Endogenous mirna sponges mediate the generation of oscillatory dynamics for a non-coding RNA network J Theor Biol. 1.833 美國克利夫蘭臨床醫(yī)院
26 環(huán)狀RNA在肺癌中的作用研究進展 Progress in research on the role of circular RNAs in lung cancer World J Surg Oncol. 1.792 東南大學醫(yī)學院
27 circRNA_0000285的上調作為鼻咽癌的預后生物標志物，參與放射敏感性 Upregulation of circRNA_0000285 serves as a prognostic biomarker for nasopharyngeal carcinoma and is involved in radiosensitivity Oncol Lett. 1.664 中南大學湘雅醫(yī)院
28 環(huán)狀RNA hsa_circ_0000523作為miRNA海綿調節(jié)結直腸癌細胞的增殖和凋亡 Circular RNA hsa_circ_0000523 regulates the proliferation and apoptosis of colorectal cancer cells as miRNA sponge Braz J Med Biol Res. 1.492 浙江同德醫(yī)院
來源：吉賽生物