歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻23篇,下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進展。

1、長鏈非編碼RNA:LINC-PINT來源的circRNA編碼多肽抑制膠質(zhì)母細胞瘤中的癌基因轉(zhuǎn)錄延伸

論文標題:A peptide encoded by circular form of LINC-PINT suppresses oncogenic transcriptional elongation in glioblastoma

雜志:Nat Commun.?影響因子:12.353

通訊作者單位:中山大學附屬第一醫(yī)院

環(huán)狀RNA種類功能都具有多樣性,關于環(huán)狀RNA直接翻譯蛋白或多肽調(diào)控細胞功能已有多篇報道。本研究前期通過高通量轉(zhuǎn)錄組和翻譯組測序分析發(fā)現(xiàn)長非編碼RNA LINC-PINT的2號外顯子可單獨形成Circ-PINT的環(huán)狀RNA,Circ-PINT包含一個完整的開放閱讀框,可能編碼多肽,進一步通過制備針對該多肽的特異性抗體并結(jié)合CRISPR/cas9基因敲除細胞株等實驗,證實Circ-PINT可通過核糖體進入位點序列IRES翻譯出87個氨基酸組成的全新多肽PINT87aa通過結(jié)合聚合酶相關因子復合物基因PAF1,抑制多種癌基因的轉(zhuǎn)錄延伸,進而抑制惡性膠質(zhì)瘤的發(fā)生和進展,細胞功能實驗表明PINT87aa通過結(jié)合聚合酶相關因子復合物基因PAF1,抑制多種癌基因的轉(zhuǎn)錄延伸,進而抑制惡性膠質(zhì)瘤的發(fā)生和進展,體內(nèi)動物實驗,在小鼠腦部原位以及皮下成瘤實驗中過表達PINT87aa蛋白的腫瘤細胞,成瘤能力大大減弱,動物生存期延長,而基因敲除低成瘤細胞中circ-PINT的編碼區(qū)的部分序列后,動物的成瘤能力得到增強,證實環(huán)狀RNA circ-PINT翻譯的多肽具有抑制腫瘤的作用。該研究結(jié)果提示環(huán)狀RNA編碼的多肽產(chǎn)物可能在惡性腫瘤診斷、預后及靶向治療方面具有重要的研究意義,該文詳細解讀見往期文章Nature Communications:長非編碼RNA形成環(huán)狀RNA翻譯功能性多肽。

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圖注:證實Circ-PINT翻譯全新多肽PINT87aa的系列實驗

2、環(huán)狀RNA-circAGO2通過HuR阻止AGO2-miRNA復合物形成維持靶基因穩(wěn)定性促進腫瘤進展

論文標題:Circular RNA circAGO2 drives cancer progression through facilitating HuR-repressed functions of AGO2-miRNA complexes

雜志:Cell Death Differ.?影響因子:8

通訊作者單位:華中科技大學同濟醫(yī)學院

Argonaute 2(AGO2)是microRNA(miRNA)誘導的沉默復合物的核心成分,在腫瘤發(fā)生和侵襲性中起著重要作用。然而,調(diào)節(jié)AGO2在癌癥中功能的機制仍然難以捉摸。在該研究中,研究者鑒定了由AGO2基因產(chǎn)生的一個內(nèi)含子來源的環(huán)狀RNA(circAGO2)在AGO2-miRNA復合物和癌癥進展中起新型調(diào)控功能。CircAGO2在胃癌,結(jié)腸癌,前列腺癌和神經(jīng)母細胞瘤中上調(diào),并且與患者預后不良有關。CircAGO2在體外和體內(nèi)實驗中可促進癌細胞的生長,侵襲和轉(zhuǎn)移。機理研究表明,circAGO2與人類抗原R(HuR)蛋白直接相互作用,circAGO2促進HuR在靶基因3’UTR區(qū)的活化和富集,從而減少AGO2結(jié)合miRNA和抑制AGO2/miRNA介導的基因沉默。在胃癌細胞中穩(wěn)定干擾circAGO2后可抑制腫瘤細胞增殖和侵襲能力,皮下成瘤實驗也表明干擾circAGO2后AGS細胞成瘤減弱,尾靜脈注射sh-circAGO2細胞后腫瘤遷移能力下降。進一步基于HuR與circAGO2相互作用的分子模擬,設計了可阻斷該相互作用的小肽HIP-13,實驗表明該多肽能有效競爭性結(jié)合內(nèi)源circAGO2,阻礙其與HuR的結(jié)合并抑制腫瘤遷移作用。這些實驗結(jié)果表明circAGO2通過直接結(jié)合HuR抑制AGO2-miRNA復合物形成進而驅(qū)動癌癥進展,為circRNA功能機制研究提供了新視角。該文詳細解讀見往期文章:Cell Death & Differentiation連發(fā)兩篇circRNA研究論文。

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圖注:體內(nèi)外實驗證實circAGO2可促進胃癌細胞增殖和遷移

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3、人造circRNA海綿樣吸附miR-21抑制胃癌細胞增殖

論文標題:Synthetic Circular RNA Functions as a miR-21 Sponge to Suppress Gastric Carcinoma Cell Proliferation

雜志:Mol Ther Nucleic Acids. 影響因子:5.66

通訊作者單位:西安交通大學第一附屬醫(yī)院

含有miRNA結(jié)合位點的miR海綿樣序列被認為是潛在的強有力的分子治療策略。天然形成的環(huán)狀RNA(circRNA)在癌細胞中顯示出了有效的miR海綿起作用。因此該研究推測人造的circRNA樣海綿可以實現(xiàn)針對特定miR缺失的治療性功能。首先將含有miR-21結(jié)合位點的線性RNA分子在體外轉(zhuǎn)錄;經(jīng)去磷酸化和磷酸化后,使用T4 RNA連接酶1將線性序列5′-3’末端連接實現(xiàn)環(huán)化。隨后研究者使用RNase R和胎牛血清評估circRNA穩(wěn)定性;使用熒光素酶報告基因,細胞增殖和細胞凋亡實驗在三種胃癌細胞系中評估合成的circRNA海綿對miR-21活性的競爭性抑制能力;還通過Tandem Mass Tag(TMT)標記技術篩查了miR-21下游蛋白質(zhì)的circRNA海綿效應,進一步通過Western blot實驗驗證。該研究結(jié)論表明,可以使用簡單的酶促連接步驟合成對RNase R耐受的人工circRNA海綿。circRNA海綿可抑制癌細胞增殖并抑制miR-21對下游蛋白質(zhì)靶標(包括癌癥蛋白質(zhì)DAXX)的活性。人造的circRNA海綿代表了一種簡單,有效,方便的策略,用于在體外實現(xiàn)特定靶向miR缺失功能,在人類疾病治療中具有潛在應用價值。

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圖注:體外人造circRNA sponges流程圖

每個結(jié)合位點序列與miR-21種子區(qū)域完全互補配對,間隔的9-12位序列含有凸起以防止RNAi切割和降解。一個PCR循環(huán)促進合成以產(chǎn)生雙鏈DNA PCR片段,然后將其克隆到TOPO PCR克隆載體中。T7 RNA聚合酶結(jié)合到位于PCR插入物5’的T7 RNA聚合酶結(jié)合位點處,產(chǎn)生大量上述miR海綿序列的線性RNA。小牛腸磷酸酶使RNA轉(zhuǎn)錄物的5’末端去磷酸化, T4多核苷酸激酶(在ATP存在下)產(chǎn)生適于連接的RNA分子。最后T4 RNA連接酶孵育將線性RNA環(huán)化,得到人造circRNA sponges。

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文獻列表

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序號 主要內(nèi)容 論文標題 雜志

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單位
1 長鏈非編碼RNA-LINC-PINT來源的circRNA編碼多肽抑制膠質(zhì)母細胞瘤中的癌基因轉(zhuǎn)錄延伸 A peptide encoded by circular form of LINC-PINT suppresses oncogenic transcriptional elongation in glioblastoma Nat Commun. 12.353 中山大學附屬第一醫(yī)院
2 環(huán)狀RNA-circAGO2通過HuR阻止AGO2-miRNA復合物形成維持靶基因穩(wěn)定性促進腫瘤進展 Circular RNA circAGO2 drives cancer progression through facilitating HuR-repressed functions of AGO2-miRNA complexes Cell Death Differ. 8 華中科技大學同濟醫(yī)學院
3 環(huán)狀RNA-ACR通過調(diào)節(jié)Pink1/FAM65B途徑抑制自噬進而減輕心肌缺血/再灌注損傷 The circular RNA ACR attenuates myocardial ischemia/reperfusion injury by suppressing autophagy via modulation of the Pink1/ FAM65B pathway Cell Death Differ. 8 青島大學醫(yī)學院
4 RNA多聚酶II轉(zhuǎn)錄的增強型TuD發(fā)夾狀miRNA吸附分子與ciRS7吸附活性比較 Enhanced Tailored MicroRNA Sponge Activity of RNA Pol II-Transcribed TuD Hairpins Relative to Ectopically Expressed ciRS7-Derived circRNAs Mol Ther Nucleic Acids. 5.66 丹麥奧胡斯大學
5 合成環(huán)狀RNA作為miR-21海綿抑制胃癌細胞增殖 Synthetic Circular RNA Functions as a miR-21 Sponge to Suppress Gastric Carcinoma Cell Proliferation Mol Ther Nucleic Acids. 5.66 西安交通大學第一附屬醫(yī)院
6 環(huán)狀RNA-circGprc5a翻譯多肽促進膀胱癌進展 Circgprc5a promoted bladder oncogenesis and metastasis through Gprc5a-targeting peptide Mol Ther Nucleic Acids. 5.66 鄭州大學第一附屬醫(yī)院
7 circRNA_104075通過調(diào)節(jié)HNF4a刺激YAP依賴性腫瘤發(fā)生,可作為肝細胞癌的診斷標志物 circRNA_104075 stimulates YAP-dependent tumorigenesis through the regulation of HNF4a and may serve as a diagnostic marker in hepatocellular carcinoma Cell Death Differ. 5.638 上海同濟大學第十人民醫(yī)院
8 Nrf2敲除小鼠的黑質(zhì)和紋狀體中差異表達的環(huán)狀RNA分析 The Differentially Expressed Circular RNAs in the Substantia Nigra and Corpus Striatum of Nrf2-Knockout Mice Cell Physiol Biochem. 5.5 河北醫(yī)科大學
9 環(huán)狀RNA在口腔鱗狀細胞癌中的表達 Circular RNA Expression in Oral Squamous Cell Carcinoma Front Oncol. 4.416 北京大學深圳醫(yī)院
10 在轉(zhuǎn)移性口腔粘膜黑色素瘤中環(huán)狀RNA的表達模式變化 Altered expression pattern of circular RNAs in metastatic oral mucosal melanoma Am J Cancer Res 3.998 上海市第九人民醫(yī)院
11 綜述:環(huán)狀RNA在心血管疾病中進展 Circular RNA in cardiovascular disease J Cell Physiol. 3.923 加拿大西部大學
12 Circ-U2AF1通過海綿樣吸附hsa-miR-7-5p去抑制神經(jīng)腫瘤學腹側(cè)抗原2促進人腦膠質(zhì)瘤 Circ-U2AF1 promotes human glioma via derepressing neuro-oncological ventral antigen 2 by sponging hsa-miR-7-5p J Cell Physiol. 3.923 南方醫(yī)科大學珠江醫(yī)院
13 Circ_0058063通過海綿吸附miR-145-5p調(diào)節(jié)CDK6以促進膀胱癌進展 Circ_0058063 regulates CDK6 to promote bladder cancer progression by sponging miR-145-5p J Cell Physiol. 3.923 中國醫(yī)科大學附屬盛京醫(yī)院
14 過表達circ_0067934作為癌基因通過miR-545/EIF3C軸促進宮頸癌進展 Overexpressed circ_0067934 acts as an oncogene to facilitate cervical cancer progression via the miR-545/EIF3C axis J Cell Physiol. 3.923 哈爾濱醫(yī)科大學附屬第四醫(yī)院
15 競爭性內(nèi)源性環(huán)狀RNA ADAMTS14通過調(diào)節(jié)鈣調(diào)神經(jīng)蛋白1的microRNA-572 /調(diào)節(jié)因子抑制肝細胞癌的進展 The competing endogenous circular RNA ADAMTS14 suppressed hepatocellular carcinoma progression through regulating microRNA-572/regulator of calcineurin 1. J Cell Physiol. 3.923 南京市六合區(qū)中醫(yī)院
16 綜述:環(huán)狀RNA作為治療試劑和靶標 Circular RNAs as Therapeutic Agents and Targets Front Physiol. 3.394 慕尼黑大學
17 用于鑒定結(jié)腸直腸癌中共表達RNA網(wǎng)絡和特征的差異表達環(huán)狀RNA的分析 Analysis of differentially expressed circular RNAs for the identification of a coexpression RNA network and signature in colorectal cancer J Cell Biochem. 2.959 新鄉(xiāng)醫(yī)科大學
18 Hsa_circ_0008309是口腔鱗狀細胞癌的潛在生物標志物 Hsa_circ_0008309 May Be a Potential Biomarker for Oral Squamous Cell Carcinoma Dis Markers 2.949 北京大學深圳醫(yī)院
19 CircRNA相關的ceRNA網(wǎng)絡揭示了下咽癌中的ErbB和Hippo信號通路 CircRNA-associated ceRNA network reveals ErbB and Hippo signaling pathways in hypopharyngeal cancer Int J Mol Med. 2.784 昆明醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院
20 Circ-DLG1促進食管鱗狀細胞癌的增殖 Circ-DLG1 promotes the proliferation of esophageal squamous cell carcinoma Onco Targets Ther. 2.656 南京醫(yī)科大學
21 CircRNA has_circ_0078710吸附microRNA-31參與肝細胞癌進展 CircRNA has_circ_0078710 acts as the sponge of microRNA-31 involved in hepatocellular carcinoma progression Gene 2.498 中山大學附屬第一醫(yī)院
22 高通量測序揭示人類增生性瘢痕中差異表達的lncRNA和circRNA及其相關的功能網(wǎng)絡 Highthroughput sequencing reveals differentially expressed lncRNAs and circRNAs, and their associated functional network, in human hypertrophic scars Mol Med Rep. 1.922 南昌市婦幼保健院
23 產(chǎn)氣莢膜梭菌C型誘導仔豬壞死性腸炎模型中脾臟環(huán)狀RNA表達譜 Circular RNA expression profile of spleen in a Clostridium perfringens type C-induced piglet model of necrotizing enteritis FEBS Open Bio. 1.782 蘭州生產(chǎn)工程技術研究中心

來源:geneseed