? ? ? ? 在生物進(jìn)化過程中,人類為了更好地適應(yīng)自身生活的環(huán)境,進(jìn)化出了包括聽覺、視覺、嗅覺、觸覺、味覺、痛覺、癢覺等多種感覺系統(tǒng)。由于感覺系統(tǒng)是人類感知外界的基本反應(yīng),也是生物體與外界交流及自我保護(hù)的基礎(chǔ),因此關(guān)于感覺系統(tǒng)的探索長(zhǎng)期以來是科學(xué)家的研究熱點(diǎn)。
  中國科學(xué)院上海藥物研究所徐華強(qiáng)課題組和山東大學(xué)孫金鵬課題組長(zhǎng)期致力于與感覺相關(guān)的GPCR受體的研究。徐華強(qiáng)課題組解析了視桿色素和Arrestin嗎,G蛋白和GRK地復(fù)合物結(jié)構(gòu),以及視覺感知的基礎(chǔ)。孫金鵬課題組則發(fā)表了與聽覺相關(guān)的受體VLGR1的研究成果,以及癢覺受體MGPRX2的研究。雖然近些年來研究黏附類GPCR與機(jī)械力的作用關(guān)系已取得一定成果,但黏附類受體感知機(jī)械力的作用機(jī)制尚不清晰。
  4月13日,上海藥物所徐華強(qiáng)團(tuán)隊(duì)聯(lián)合山東大學(xué)孫金鵬團(tuán)隊(duì)以及德國Rudolf Schonheimer生物化學(xué)研究所Ines Liebscher團(tuán)隊(duì),共同在Nature在線發(fā)表了題為Structural basis for the tethered peptide activation of adhesion GPCRs的最新研究成果,解析了感知機(jī)械力的黏附類受體GPR133、GPR114與下游蛋白Gs的復(fù)合物電鏡結(jié)構(gòu),證明了受體感知機(jī)械力后通過Stachel序列激活受體,闡明了受體對(duì)Stachel序列(tethered peptide)的識(shí)別與受體自激活的機(jī)制。
  “力”能決定細(xì)胞命運(yùn),生命體對(duì)力的感知十分重要,機(jī)械力刺激驅(qū)動(dòng)許多生理過程,包括觸覺、痛覺、聽覺和平衡調(diào)節(jié)。在細(xì)胞生物學(xué)的發(fā)展過程中,人們逐漸意識(shí)到細(xì)胞可以感知機(jī)械外力傳遞的信號(hào)并做出多種生理變化,機(jī)械外力對(duì)于細(xì)胞的動(dòng)態(tài)以及機(jī)體的正常生長(zhǎng)運(yùn)行十分重要。例如,耳對(duì)風(fēng)力的感知,肺對(duì)氣體壓入的感知,皮膚細(xì)胞對(duì)按壓力的感知,這些生理過程均與機(jī)械力的感知密不可分。其中一些特化的細(xì)胞進(jìn)化成為專門感知機(jī)械力的“終端”,如觸覺受體Piezo家族蛋白能夠感知機(jī)械力,聽覺相關(guān)受體TMC在耳蝸毛細(xì)胞中通過機(jī)械力介導(dǎo)聽覺傳導(dǎo),這些是普遍認(rèn)知的能夠感知機(jī)械力的離子通道受體。GPCR作為另一大類膜受體也能感知機(jī)械力,其對(duì)力的感知大多通過黏附類受體家族進(jìn)行,如GPR114、GPR133、GPR126、GPR56等,這緣于其獨(dú)特的結(jié)構(gòu)和功能特征。黏附類受體(aGPCR)具有巨大的含有眾多結(jié)構(gòu)域的胞外端,胞外端參與受體與受體以及受體與細(xì)胞基質(zhì)間的相互作用,它與機(jī)械力的感知密切相關(guān),然而黏附類受體感知機(jī)械力后如何激活并進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)尚不清楚。
  黏附類受體另一個(gè)顯著的結(jié)構(gòu)特征是含有GAIN(GPCR autoproteolysis-inducing)結(jié)構(gòu)域和GPS(GPCR proteolytic site)自水解位點(diǎn),大多數(shù)黏附類受體GPS可以發(fā)生自水解反應(yīng),將受體切割為NTF(N-terminal fragment)和CTF(C-terminal fragment)兩個(gè)片段,受體CTF N端大約十幾個(gè)氨基酸可以作為激動(dòng)劑將受體激活并招募下游G蛋白,該部分序列稱為Stachel序列或栓系激動(dòng)劑(TA, Tethered agonist)。aGPCR與其他家族GPCR不同的一個(gè)重要特征是其能夠依賴Stachel序列自激活。前期研究證明了小分子配體可以直接與黏附類受體7次跨膜核心結(jié)合并激活受體。但是黏附類受體自激活狀態(tài)下的作用機(jī)制仍不清楚。目前已報(bào)道的Stachel序列介導(dǎo)的aGPCR激活至少有三種激活模式(圖1):(1)Stachel序列在GPS處自水解后,NTF與CTF解離,Stachel序列暴露,然后與TMD相互作用;(2)Stachel序列與TMD有預(yù)結(jié)合或間歇的相互作用,該作用通過配體刺激或機(jī)械力穩(wěn)定下來;(3)Stachel序列與TMD接觸通過GAIN結(jié)構(gòu)域內(nèi)部構(gòu)象變化調(diào)節(jié)。每個(gè)假設(shè)均有實(shí)驗(yàn)支持,但也相互矛盾。例如,GAIN結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu)顯示Stachel序列被隱藏為無法與TMD相互作用的β折疊,這與某些能被Stachel序列激活的aGPCRs的高組成活性相沖突。因此Stachel序列如何激活受體尚不清楚。
  針對(duì)上述兩個(gè)問題,科研人員以黏附類受體GPR133和GPR114作為模型進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,探究Stachel序列介導(dǎo)的aGPCR激活機(jī)制。GPR133GPS位點(diǎn)發(fā)生水解,在質(zhì)膜上發(fā)生NTF-CTF分離。GPR114不發(fā)生自水解,能夠感知機(jī)械力。
  Stachel序列可以作為激動(dòng)劑激活GPR133, GPR114受體,招募下游Gs蛋白。生化實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,GPR133/GPR114去掉NTF后本底活性明顯高于全長(zhǎng)受體以及缺少Stachel序列的CTF結(jié)構(gòu)。通過體外合成受體Stachel序列刺激去掉Stachel序列的CTF片段,同樣證明Stachel序列能作為激動(dòng)劑激活受體。此外,研究發(fā)現(xiàn),機(jī)械力通過調(diào)控Stachel與受體的結(jié)合來激活受體。研究人員對(duì)野生型以及GPR133 GPS位點(diǎn)突變(失去自剪切功能)受體分別進(jìn)行機(jī)械力檢測(cè),發(fā)現(xiàn)均可以感知機(jī)械力。研究還發(fā)現(xiàn),將人NTF上的重要位點(diǎn)突變并沒有影響其機(jī)械力的感知效果,側(cè)面印證了機(jī)械力的作用方式是通過NTF的振動(dòng)構(gòu)象改變,使Stachel序列暴露,然后與受體進(jìn)行結(jié)合從而激活受體?;诖私Y(jié)果,研究將受體結(jié)合口袋中與Stachel相互作用位點(diǎn)進(jìn)行突變,發(fā)現(xiàn)機(jī)械力作用有不同程度的降低,因此得出結(jié)論——機(jī)械力是通過調(diào)控Stachel與受體的結(jié)合來激活受體(圖2)。
  通過復(fù)合物冷凍電鏡結(jié)構(gòu)解析,研究發(fā)現(xiàn)了Stachel序列HIM結(jié)構(gòu)介導(dǎo)其與受體相互作用。為探究Stachel序列與受體之間的作用關(guān)系,研究人員解析了GPR133-CTF-Gs-Nb35和GPR114-CTF-Gs-scFv16復(fù)合物的低溫電鏡結(jié)構(gòu),分辨率分別為3.1 埃和3.3 埃(圖3a)。GPR133-CTF和GPR114-CTF的總體TMD排列與團(tuán)隊(duì)最近解析的黏附受體GPR97結(jié)構(gòu)差別較大,更類似于分泌素樣GPCR(ClassB1)結(jié)構(gòu),在TM6和TM7存在兩個(gè)kink結(jié)構(gòu)。GPR133-CTF和GPR114-CTF的Stachel序列均折疊在被跨膜螺旋和ECL2包圍的正構(gòu)結(jié)合位點(diǎn)口袋內(nèi),Stachel序列在口袋內(nèi)部形成α螺旋結(jié)構(gòu)(圖3b)。Stachel序列中5個(gè)疏水氨基酸組成的保守HIM (Fss-03xφφφxφss-09)在Stachel序列與受體相互作用中起核心作用(圖3c)。Fss-03, φss-06, φss-07三個(gè)氨基酸側(cè)鏈朝向配體結(jié)合口袋內(nèi)側(cè),φss-05側(cè)鏈朝向口袋外側(cè),最后一位φss-09與TM5以及ECL2上的氨基酸形成一個(gè)疏水口袋(圖3d-i)。
  在GPR133-CTF和GPR114-CTF受體中均發(fā)現(xiàn)了保守切換開關(guān)W6.53,它可以感知Stachel序列的結(jié)合,介導(dǎo)受體的激活。Q/Y7.49和保守的N5.50與P6.47/ V6.47 φφG6.50基序形成氫鍵網(wǎng)絡(luò),其對(duì)穩(wěn)定TM6和TM7的kink結(jié)構(gòu)十分重要。在kink結(jié)構(gòu)的下方,TM6和TM7末端向外傾斜,形成更大的細(xì)胞質(zhì)空腔,促進(jìn)與G蛋白偶聯(lián)。與其他GPCR不同的是,GPR114具有延伸的TM7,擴(kuò)展TM7插入到Gαs和Gβ1亞基之間產(chǎn)生的凹槽中,延伸螺旋可能在其細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)中發(fā)揮重要作用。
  綜上所述,研究人員首先通過功能實(shí)驗(yàn)證明了受體感知機(jī)械力后通過Stachel序列激活受體,冷凍電鏡結(jié)構(gòu)解析進(jìn)一步確定了Stachel中的5個(gè)疏水氨基酸組成的保守HIM (Fss-03xφφφxφss-09)在Stachel序列與受體相互作用中起核心作用,闡明了Stachel序列被受體識(shí)別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),揭示了黏附類受體在機(jī)械力作用下依賴Stachel序列激活的激活機(jī)制,拓展了對(duì)于Stachel序列介導(dǎo)的aGPCR與G蛋白偶聯(lián)機(jī)制的認(rèn)知,并為Stachel序列外源短肽設(shè)計(jì)提供了依據(jù)。
  研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃基金、國家杰出青年科學(xué)基金、國家優(yōu)秀青年科學(xué)基金、國家自然科學(xué)基金委重點(diǎn)基金和山東省優(yōu)秀青年基金的支持。

研究揭示粘附類受體的自激活機(jī)制及對(duì)機(jī)械力感知的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)-肽度TIMEDOO

圖1.aGPCR依賴Stachel激活的三種假設(shè)模型
研究揭示粘附類受體的自激活機(jī)制及對(duì)機(jī)械力感知的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)-肽度TIMEDOO

圖2.機(jī)械力感知aGPCR激活機(jī)制示意圖

研究揭示粘附類受體的自激活機(jī)制及對(duì)機(jī)械力感知的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)-肽度TIMEDOO
圖3.GPR133 GPR114結(jié)構(gòu)模型
來源: 上海藥物研究所