2.網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)SCI論文研讀分析

3.網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路及技術(shù)路線

4.生物網(wǎng)絡(luò)的介紹

5.網(wǎng)絡(luò)分析介紹

1）常用中藥數(shù)據(jù)及使用：TCMSP

2）中藥高通量實(shí)驗(yàn)和參考數(shù)據(jù)庫(kù)：Herb

3）中醫(yī)藥證候關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫(kù)：SymMap

4）CTD數(shù)據(jù)庫(kù)

5）基于文獻(xiàn)的草藥成分和靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)：HIT 2.0

6）中醫(yī)藥百科全書(shū)數(shù)據(jù)庫(kù)：ETCM

7)中藥分子機(jī)制研究的在線生物信息學(xué)分析工具：BATMAN-TCM

7.中藥有效成分靶點(diǎn)預(yù)測(cè)的查詢及獲取

1）化合物與蛋白質(zhì)互作：STITCH

2）中藥有效成分靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)：SwissTargetPrediction

3）基于有效成分結(jié)構(gòu)特征靶點(diǎn)預(yù)測(cè)：PharmMapper

4）中藥有效成分靶點(diǎn)的獲?。悍聪蛱摂M篩選方法

5）SuperPred

6）SEA數(shù)據(jù)庫(kù)

7）bSDTNBI數(shù)據(jù)庫(kù)

實(shí)戰(zhàn)

1）人類疾病與基因遺傳變異數(shù)據(jù)庫(kù)：OMIM

2）疾病相關(guān)的基因與突變位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)：DisGeNet

3）人類基因數(shù)據(jù)庫(kù)：Genecards

4）治療靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)：TTD

5）CTD數(shù)據(jù)庫(kù)

實(shí)戰(zhàn)

10.GO富集分析

11.KEGG富集分析

13.蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)查詢和可視化分析：STRING

14.富集分析數(shù)據(jù)庫(kù)：DAVID

15.Metascape功能富集分析和信號(hào)通路富集分析

16.富集GO term BP，CC，MF三合一柱狀圖繪制

17.通路氣泡圖的繪制

18.相互作用可視化PyMOL

實(shí)戰(zhàn)

1）分析數(shù)據(jù)導(dǎo)入與導(dǎo)出

2）基本拓?fù)涮卣饔?jì)算

3）重要節(jié)點(diǎn)識(shí)別

4）網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲笜?biāo)含義

5）子網(wǎng)絡(luò)提取

6）網(wǎng)絡(luò)可視化

7）圖形導(dǎo)出

8）Cytoscape插件的安裝和使用

實(shí)戰(zhàn)

21.?小分子化合物結(jié)構(gòu)信息查詢：Pubchem、Drugbank

22.分子對(duì)接

1）對(duì)接軟件的介紹及安裝

2）小分子和蛋白結(jié)構(gòu)文件的預(yù)處理

3）蛋白活性位點(diǎn)的確定

4）分子對(duì)接流程的介紹及實(shí)戰(zhàn)

5）分子對(duì)接結(jié)果相互作用分析及可視化

實(shí)戰(zhàn)