北京大學(xué)張澤民團(tuán)隊(duì)通過跨組織單細(xì)胞多組學(xué)揭示肌成纖維細(xì)胞的多樣化免疫調(diào)節(jié)特征
成纖維細(xì)胞是維持組織穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)細(xì)胞,在纖維化、炎癥和癌癥等疾病狀態(tài)下呈現(xiàn)出多種表型來影響疾病進(jìn)程及其治療抗性1,2。肌成纖維細(xì)胞(myofibroblasts)因其對(duì)腫瘤微環(huán)境的關(guān)鍵調(diào)控作用,近年來受到廣泛關(guān)注。研究發(fā)現(xiàn),它們?cè)谝认侔?、乳腺癌和結(jié)腸癌等多種癌癥中表現(xiàn)出顯著的免疫抑制作用3—5;然而,肌成纖維細(xì)胞的異質(zhì)性、在不同疾病狀態(tài)下的分布特征、空間定位及其與其它免疫細(xì)胞的互作機(jī)制仍有待深入研究。
2024年9月19日,深圳灣實(shí)驗(yàn)室/北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)張澤民課題組在Cancer Cell上發(fā)表一篇題為“Cross-tissue human fibroblast atlas reveals myofibroblast subtypes with distinct roles in immune modulation”的研究。該研究基于健康、纖維化、炎癥以及癌癥等多種疾病狀態(tài)下的11種組織的單細(xì)胞數(shù)據(jù),構(gòu)建了涵蓋517個(gè)人類樣本、269,899個(gè)成纖維細(xì)胞的圖譜,并鑒定出20種成纖維細(xì)胞亞型,揭示了成纖維細(xì)胞未被充分認(rèn)識(shí)的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性,其中發(fā)現(xiàn)了4類具有獨(dú)特表型的肌成纖維細(xì)胞亞型。通過整合空間轉(zhuǎn)錄組、多重免疫組化和體外實(shí)驗(yàn),該研究進(jìn)一步揭示了肌成纖維細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境中的獨(dú)特免疫調(diào)控功能,為開發(fā)腫瘤微環(huán)境特異性靶向治療策略提供了新的思路。
這項(xiàng)研究揭示了組織和疾病環(huán)境在塑造成纖維細(xì)胞表型及其分布中的關(guān)鍵作用。在慢性炎癥和纖維化疾病中,肌成纖維細(xì)胞亞型逐漸增多,并在癌癥進(jìn)展過程中不斷累積,表明腫瘤環(huán)境對(duì)成纖維細(xì)胞表型的重塑作用。通過調(diào)控成纖維細(xì)胞的信號(hào)傳導(dǎo)和代謝通路,最終促成了免疫抑制腫瘤微環(huán)境的形成。這些發(fā)現(xiàn)為成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)錄可塑性提供了有力證據(jù),支持了成纖維細(xì)胞從啟動(dòng)和支持炎癥到最終抑制炎癥的不同表型之間動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)換的觀點(diǎn)2。
相比于其他肌成纖維細(xì)胞亞型,LRRC15+肌成纖維細(xì)胞表現(xiàn)出終末分化特征,可能來源于兩大細(xì)胞亞型——祖細(xì)胞樣成纖維細(xì)胞(PI16+和COL15A1+)以及周細(xì)胞(RGS5+)。多重免疫組化染色進(jìn)一步證實(shí),在腫瘤區(qū)域表達(dá)周細(xì)胞標(biāo)志物(MCAM+、PDGFRβ+)的LRRC15+成纖維細(xì)胞,表明其潛在的周細(xì)胞來源。而PI16+成纖維細(xì)胞則位于癌旁間質(zhì)區(qū)域,研究揭示特定細(xì)胞因子促進(jìn)其表型形成。進(jìn)一步研究這些成纖維細(xì)胞亞型與免疫細(xì)胞的互作模式和空間定位特征,發(fā)現(xiàn)PI16+成纖維細(xì)胞和LRRC15+成纖維細(xì)胞在多種癌癥類型中參與了不同的空間多細(xì)胞模塊(CMs)。其中PI16+成纖維細(xì)胞與CX3CR1+Temra細(xì)胞和LYVE1+巨噬細(xì)胞相互作用,表現(xiàn)出抗腫瘤免疫特征;而LRRC15+成纖維細(xì)胞則與SPP1+巨噬細(xì)胞共定位于癌巢區(qū)域,顯示出免疫排斥功能。根據(jù)成纖維細(xì)胞祖細(xì)胞或終末分化肌成纖維細(xì)胞的豐度對(duì)腫瘤患者進(jìn)行分型,發(fā)現(xiàn)其在多個(gè)癌種中具有顯著預(yù)后差異,支持兩種成纖維細(xì)胞亞型在腫瘤微環(huán)境中的不同作用,該發(fā)現(xiàn)為患者分型和臨床治療策略提供了新方向。
此外,這項(xiàng)研究還發(fā)現(xiàn)了一類具有炎性特征的MMP1+肌成纖維細(xì)胞,通過與Treg細(xì)胞和LAMP3+樹突狀細(xì)胞共同構(gòu)建免疫抑制微環(huán)境來促進(jìn)免疫逃逸。MMP1+成纖維細(xì)胞可能通過CCL2-CCR4等途徑招募Treg細(xì)胞,并通過分泌TGF-β和IL-11促進(jìn)免疫耐受環(huán)境的形成,通過分泌MMPs等蛋白參與組織重塑,進(jìn)一步影響免疫細(xì)胞的遷移和功能。MMP1+和LRRC15+成纖維細(xì)胞特征在不同癌種的免疫治療無響應(yīng)者中顯著富集,表明它們?cè)谔囟ò┓N中有望成為癌癥治療中的聯(lián)合治療靶點(diǎn)。
圖1 人類跨組織成纖維細(xì)胞圖譜概覽圖
綜上所述,該研究全面探討了在不同組織和疾病背景下成纖維細(xì)胞的表型和分布特征,并揭示了不同肌成纖維細(xì)胞在免疫調(diào)控中的獨(dú)特作用。這些發(fā)現(xiàn)將進(jìn)一步深化對(duì)疾病相關(guān)成纖維細(xì)胞的理解,并為患者分型和開發(fā)新的聯(lián)合治療方案提供重要線索。
深圳灣實(shí)驗(yàn)室助理研究員高洋、昌平實(shí)驗(yàn)室助理研究員李佳楠、北京大學(xué)前沿交叉學(xué)科研究院CLS項(xiàng)目博士生程文鳳為該論文的并列第一作者,張澤民、廣東醫(yī)科大學(xué)附屬東莞第一醫(yī)院的侯文洪為該論文的共同通訊作者。研究得到了深圳灣實(shí)驗(yàn)室重大項(xiàng)目和深圳灣實(shí)驗(yàn)室開放基金、中國(guó)博士后科學(xué)基金和粵莞聯(lián)合基金的資助。深圳灣實(shí)驗(yàn)室超算中心為該研究提供計(jì)算資源支持。
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來源:北京大學(xué)


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