Illumina發(fā)起的Actionable Genome Consortium于周三報告稱，非小細胞肺癌患者的游離DNA基因分型結果在大多數情況下與腫瘤組織的分型結果一致。當組織活檢無法實施時，這一點特別有用。

這個聯盟由紀念斯隆凱特琳癌癥中心、Dan-Farber癌癥中心、MD Anderson癌癥中心、Grail和Illumina的研究人員組成。本周，他們在《Annals of Oncology》雜志上發(fā)表了這項成果。

研究人員分析了127名非小細胞肺癌患者的游離DNA（cfDNA）樣本，重點關注37個與肺癌相關的基因。他們以大約5萬倍的覆蓋度對這些基因進行了超深度測序。此外，所有患者都接受了專業(yè)醫(yī)療中心的腫瘤組織基因分型。

腫瘤組織測序確定了91名患者的驅動突變，而cfDNA檢測在其中68名患者中發(fā)現了一致的結果，敏感性達到75%。對于腫瘤測序未發(fā)現驅動突變的19個樣本，cfDNA測序的一致性達到100%。另外還有17個樣本因量不足無法開展組織測序，但cfDNA檢測確定了其中4個樣本的驅動突變。

當研究人員評估不一致的樣本時，他們注意到了幾個因素。一個關鍵因素是患者血液中cfDNA的含量。濃度越低，cfDNA檢測發(fā)現突變的可能性就越小。不過，這項分析能夠檢測到等位基因頻率低至0.14%的變異。

另一個潛在因素是組織活檢和血液活檢的間隔時間。研究人員稱，對于23個組織活檢檢測到驅動突變而cfDNA分析未檢測到的病例，血漿是在組織活檢后200多天采集的，因此腫瘤可能已經進化，或者治療降低了腫瘤負荷。不過，由于樣本量小，他們無法得出任何明確的結論。

越來越多的證據表明，cfDNA測序可作為一種非侵入性的方法，對患者腫瘤進行基因分型。這一點對肺癌患者特別有利，因為組織活檢有時候存在風險。此次的研究結果又增添了一份證據。

值得一提的是，Guardant Health一直在努力讓血液型癌癥檢測成為一線基因分型檢測。根據他們的研究結果，Guardant的cfDNA檢測能夠比組織活檢更快鑒定出肺癌患者的更多可行動的突變。

Actionable Genome Consortium的研究人員總結道，cfDNA分析不能替代診斷活檢的組織學確認。他們認為，cfDNA檢測可以在組織活檢之前使用，因為它具有高特異性、非侵入性且檢測周期短。不過，由于敏感性中等，故cfDNA陰性結果應推動組織活檢。（生物通 薄荷）

原文檢索

Ultra-deep next-generation sequencing of plasma cell-free DNA in patients with advanced lung cancers: results from the Actionable Genome Consortium

Annals of Oncology, mdz046, https://doi.org/10.1093/annonc/mdz046

?