昆明動(dòng)物所在抑郁癥功能基因組學(xué)研究方面取得進(jìn)展
抑郁癥是目前最常見(jiàn)的精神疾病之一,以興趣或愉悅喪失、情緒沮喪、認(rèn)知功能受損、絕望、焦慮和睡眠障礙等為主要臨床特征。流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),約6%成年人受抑郁癥影響,且抑郁癥患者的自殺率比正常人高約20倍。高的患病率和死亡率使得抑郁癥成為全球主要的疾病負(fù)擔(dān)和致殘?jiān)颉4罅垦芯勘砻鳎?a target="_blank" href="http://sdkeao.cn/tag/%e6%8a%91%e9%83%81%e7%97%87" title="View all posts in 抑郁癥">抑郁癥可由遺傳和環(huán)境因素引起,抑郁癥的遺傳力為37%左右,表明遺傳因素在抑郁發(fā)生中具有一定作用。近5年來(lái),抑郁癥的遺傳學(xué)研究取得重要進(jìn)展。通過(guò)利用全基因組范圍內(nèi)的關(guān)聯(lián)分析(GWAS),目前已經(jīng)成功鑒別到超過(guò)100個(gè)抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)基因座(loci)。然而,這些風(fēng)險(xiǎn)基因座內(nèi)的遺傳變異如何影響抑郁癥的易感目前仍不清楚。
通過(guò)利用功能基因組學(xué)研究方法,中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所羅雄劍課題組較為系統(tǒng)地研究了抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)遺傳變異的調(diào)控機(jī)制。結(jié)合染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序(ChIP-Seq)和位置矩陣(position weight matrix, PWM)數(shù)據(jù),鑒別到34個(gè)打斷與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)遺傳變異。利用系列功能實(shí)驗(yàn)(包括報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)、等位基因特異性表達(dá)分析及CRISPR-CAS9介導(dǎo)的基因編輯)系統(tǒng)性地研究了這些功能遺傳變異調(diào)控靶基因的潛在機(jī)制。進(jìn)一步的表達(dá)數(shù)量性狀基因座分析揭示了受這些功能性遺傳變異調(diào)控的潛在靶基因。研究結(jié)果提示這些遺傳變異可能同影響與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,進(jìn)而調(diào)控抑郁癥易感基因的表達(dá),最終導(dǎo)致抑郁癥發(fā)生。
該研究從GWAS鑒別到的抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)遺傳變異中甄別出具有功能后果(或者潛在致?。┑倪z傳變異,提示這些功能風(fēng)險(xiǎn)遺傳變異可能通過(guò)影響與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合進(jìn)而調(diào)控抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)基因的表達(dá),并初步鑒別出受這些功能遺傳變異調(diào)控的靶基因。進(jìn)一步對(duì)這些功能遺傳變異(或者致?。┘鞍谢虻难芯繉⒂兄诮馕鲆钟舭Y的遺傳機(jī)制和致病機(jī)理,從而為抑郁癥的治療提供新的潛在靶點(diǎn)。
該研究已經(jīng)以Regulatory mechanisms of major depressive disorder risk variants為題,在線發(fā)表于Molecular Psychiatry上。昆明動(dòng)物所博士研究生李世武和李一凡為文章的共同第一作者,昆明動(dòng)物所研究員羅雄劍為文章的通訊作者。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、云南省科技廳創(chuàng)新研究團(tuán)隊(duì)以及云南省重點(diǎn)研究項(xiàng)目的資助。
抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)功能遺傳變異rs3101339可能通過(guò)影響與REST轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合調(diào)控NEGR1基因表達(dá)
來(lái)源: 昆明動(dòng)物研究所


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