8月24日,《自然-代謝》(Nature Metabolism)在線發(fā)表了中國科學院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院劉興國課題組的研究成果。該研究提出由母系轉(zhuǎn)錄因子Glis1調(diào)控多能干細胞命運的“表觀組-代謝組-表觀組”的跨界級聯(lián)反應(yīng)新概念,表明Glis1實現(xiàn)衰老細胞重編程并穩(wěn)定基因組的功能,揭示Glis1介導“表觀組-代謝組-表觀組”的級聯(lián)反應(yīng)中,糖酵解代謝組驅(qū)動的組蛋白乙?;腿樗峄揎椩谇捌诤秃笃诘谋碛^遺傳組連接中發(fā)揮“他山之石”的重要作用。
誘導多能干細胞(iPSC)技術(shù)為研究人類疾病病理和再生醫(yī)學治療提供廣闊前景,是研究細胞命運轉(zhuǎn)變的良好模型。iPSC重編程機理在不同層次被廣泛研究,包括表觀層次、轉(zhuǎn)錄層次、代謝層次以及細胞層次等。然而,重編程中多層次是否及怎樣“跨界”調(diào)控干細胞命運,是一個尚不清楚的基本科學問題。

該研究著眼于被稱為“Yamanaka第五因子”的Glis1,這一母系轉(zhuǎn)錄因子只在卵子和受精卵中表達。研究團隊發(fā)現(xiàn)Glis1不僅促進正常細胞重編程,還實現(xiàn)衰老細胞重編程。同時,由Glis1得到的iPSC基因組更加穩(wěn)定。這些表明Glis1是一個強有力的細胞命運決定因子。

劉興國團隊運用染色質(zhì)免疫共沉淀測序和轉(zhuǎn)錄組測序聯(lián)合分析、靶向代謝物組學、染色質(zhì)開放性測序等多組學技術(shù),解析和歸納Glis1介導多能性獲得的獨特3階段途徑——“表觀組-代謝組-表觀組”跨界級聯(lián)反應(yīng)。階段1:隨機階段,此級聯(lián)反應(yīng)在重編程早期由Glis1與體細胞基因和糖酵解基因的啟動子結(jié)合而啟動。Glis1的結(jié)合會關(guān)閉體細胞基因的表達,并開啟糖酵解基因的表達。階段2:化蛹成蝶階段,糖酵解基因的表達激活這一通路,同時線粒體氧化磷酸化未受影響。因而促進細胞從線粒體氧化磷酸化到糖酵解的代謝重塑,上調(diào)的糖酵解產(chǎn)生更多的代謝物——乙酰輔酶A和乳酸。這兩類代謝物是代謝與表觀遺傳聯(lián)系的關(guān)鍵分子。階段3:決定階段,乙酰輔酶A和乳酸水平的提高分別調(diào)控“第二波”基因和多能性基因啟動子上的組蛋白乙?;揎椇腿樗峄揎棧谌旧|(zhì)水平打開并促進基因轉(zhuǎn)錄表達,加速多能性的獲得。因此,階段2通過獨特的代謝重塑連接階段1和3,實現(xiàn)表觀基因組信號的級聯(lián)擴增。

該研究提出細胞命運調(diào)控的“表觀組-代謝組-表觀組”跨界級聯(lián)反應(yīng)概念,具有生理病理意義。Glis1不僅在母系細胞中高表達,而且在如癌細胞的病理條件中同樣高表達。此概念適用于眾多表觀因子,為細胞與發(fā)育的生理調(diào)控和病理發(fā)現(xiàn)提供理論基礎(chǔ)。

研究發(fā)現(xiàn),由乳酸產(chǎn)生的新型組蛋白乳酸化修飾調(diào)控細胞干性。這是繼組蛋白乳酸化修飾2019年10月在巨噬細胞極化中被發(fā)現(xiàn)后,發(fā)現(xiàn)此修飾調(diào)控細胞轉(zhuǎn)換。在7月20日Nature Metabolism的觀點文章中,乳酸這一被認為代謝領(lǐng)域的“丑小鴨”正在成為代謝重塑的“白天鵝”。劉興國團隊的發(fā)現(xiàn)為這一新興方向奠定基礎(chǔ)。

科研人員將跨界級聯(lián)反應(yīng)比喻為“蝴蝶效應(yīng)”:轉(zhuǎn)錄因子Glis1如蝶戀花的微風,引發(fā)全基因組水平多能性的“龍卷風”,這一蝴蝶效應(yīng),并非只依靠基因組水平可以完成,需要“他山之石”——代謝水平跨界來連接,形成“表觀組-代謝組-表觀組”的級聯(lián)反應(yīng)三部曲。體細胞要返老還童,回到精卵“一如初見”的多能性狀態(tài),需要代謝這一跨界伏筆。

研究工作與復(fù)旦大學合作完成,獲得國家重點研發(fā)項目、國家自然科學基金、中科院、廣東省、廣州市、博士后啟動經(jīng)費的支持。

論文鏈接

廣州生物醫(yī)藥與健康研究院: 發(fā)現(xiàn)細胞命運調(diào)控的“表觀組-代謝組-表觀組”跨界蝴蝶效應(yīng)-肽度TIMEDOO

多能干細胞命運調(diào)控的“表觀組-代謝組-表觀組”跨界蝴蝶效應(yīng)

來源:廣州生物醫(yī)藥與健康研究院