2022年11月11日，北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院伊成器課題組和合作者聯(lián)合在Nature Biotechnology雜志上在線發(fā)表了題為“Re-engineering the adenine deaminase TadA-8e for efficient and specific CRISPR-based cytosine base editing”的研究成果。該項(xiàng)研究通過(guò)在TadA-8e腺嘌呤脫氨酶中引入N46L突變，成功將其轉(zhuǎn)變?yōu)閷Ｒ磺腋咝У陌奏っ摪泵?，并以此為基礎(chǔ)開發(fā)了新型的堿基編輯器Td-CGBE與Td-CBEs。

文章題目截圖

相比于傳統(tǒng)的基于AID/APOBEC家族的CGBE/CBE堿基編輯器，Td-CGBE/CBEs編輯器在編輯活性與之類似的情況下，展現(xiàn)出更窄的編輯窗口和更低的插入、缺失副產(chǎn)物等編輯特性。同時(shí)，研究利用之前開發(fā)的全基因組、無(wú)偏好性的脫靶檢測(cè)技術(shù)Detect-seq，對(duì)Td-CBEs編輯器進(jìn)行了脫靶評(píng)估。評(píng)估發(fā)現(xiàn)，Td-CBEs在全基因組水平所造成的脫靶位點(diǎn)要遠(yuǎn)少于同等編輯活性的傳統(tǒng)CBEs；雖然Td-CBEs與傳統(tǒng)堿基編輯器BE4max基于不同的脫氨酶構(gòu)建，但Td-CBEs相比于BE4max不會(huì)產(chǎn)生新的脫靶位點(diǎn)。值得注意的是，Td-CBEs也并不會(huì)產(chǎn)生之前課題組發(fā)現(xiàn)的兩類新型脫靶編輯（out-of-protospacer edits與target-strand edits）。

利用Detect-seq技術(shù)對(duì)Td-CBEs進(jìn)行脫靶檢測(cè)與評(píng)估

以上結(jié)果表明，Td-CBEs是一種較傳統(tǒng)CBEs更為安全的堿基編輯器，為未來(lái)遺傳疾病的基因治療帶來(lái)了更大的可能。同時(shí)，Detect-seq作為一種平臺(tái)技術(shù)，可以為開發(fā)更安全、高效的基因編輯工具提供強(qiáng)有力的支持與幫助。

伊成器教授和華東師范大學(xué)李大力教授、劉明耀教授為本文通訊作者。華東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究生陳亮、朱碧云、汝高盟，以及北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后孟浩巍、博士研究生閆永昌為本論文的共同第一作者。北京大學(xué)前沿交叉學(xué)院雷芷芯博士、博士研究生烏浩在本研究中作出了重要貢獻(xiàn)。該工作得到科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目資助。北京大學(xué)高性能計(jì)算平臺(tái)、生命科學(xué)學(xué)院儀器中心及鳳凰工程等多個(gè)平臺(tái)對(duì)本項(xiàng)目提供了重要的技術(shù)支撐。

來(lái)源：北京大學(xué)