2023.7.25-28|生物醫(yī)學公共數(shù)據深度挖掘及應用培訓班
還在認為沒有實驗就不能發(fā)表論文？
手頭有很多數(shù)據，不知道該怎么進一步挖掘？
還在為不知道如何找靶點而苦惱？
還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數(shù)據庫而痛苦不堪？
還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神？
快來參加北京市計算中心舉辦的生物醫(yī)學公共數(shù)據深度挖掘及應用培訓班吧！
本次培訓對目前公共數(shù)據挖掘熱點進行系統(tǒng)介紹，提供一次系統(tǒng)了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數(shù)據庫數(shù)據產生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數(shù)據庫挖掘多組學數(shù)據，以便為自身科研項目服務。歡迎報名參加。更多消息可關注“生信會議”公眾號，會給您帶來更多驚喜！
授課對象：
從事生物醫(yī)學研究的臨床醫(yī)生、轉化研究科研人員；
課題經費不足，無法進行大規(guī)模測序，但需要發(fā)表SCI論文的相關研究人員；
已獲得轉錄組、基因組等多組學數(shù)據，需要進一步挖掘分析人員；
對生物醫(yī)學大數(shù)據分析與挖掘感興趣的其他人員。
培訓效果：
短、平、快，為基金申請保駕護航，發(fā)表paper如虎添翼；
掌握多組學數(shù)據分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數(shù)據處理沒有壓力；
科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；
一套數(shù)據多角度演練，更易掌握分析思路。
主辦單位：北京市計算中心有限公司
協(xié)辦單位：北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心
云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地
北京市大數(shù)據教學實踐基地
舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產業(yè)3號樓；亦可聽取線上直播
課程安排：2023年7月25-28日（周二-周五）?上9:30-11:30 下13:30-17:00
| 時間 | 主題 | 內容 | 備注 |
| 第一天 | 組學及生物信息學概述 | 1、組學研究概述（基因組學、轉錄組學、表觀組學、蛋白質組學、代謝組學及相關技術介紹）
2、實驗設計及測序原理 3、生物信息學背景知識介紹 |
理論 |
| 公共數(shù)據庫挖掘熱點介紹 | 1、人工智能研究在病理切片識別上的應用
2、人工智能多組學數(shù)據整合分析 |
理論 | |
| 常用生物醫(yī)學數(shù)據庫介紹 |
1、用生物醫(yī)學數(shù)據庫介紹：
1）大型綜合數(shù)據庫：NCBI、UCSC 2）公共高通量測序數(shù)據庫：SRA 3）公共基因表達譜數(shù)據庫：GEO 4）公共癌癥多組學數(shù)據庫：TCGA 2、各大數(shù)據庫數(shù)據下載 |
理論
+演示 |
|
| 第二天 | R語言入門 | 1、R語言簡介
2、R語言安裝及配置 3、R語言數(shù)據結構 4、R語言數(shù)據處理 5、R語言繪圖 |
理論
+實戰(zhàn) |
| 基于公共數(shù)據的Biomarker挖掘鑒定演練（一） |
1、差異表達分析及結果可視化：
1）edgeR包使用 2）火山圖繪制 3）聚類熱圖繪制 2、GO、KEGG功能富集分析及結果可視化： 1）GO富集分析 2）KEGG富集分析 3）富集分析氣泡圖繪制 |
理論
+實戰(zhàn) |
|
| 第三天 | 基于公共數(shù)據的Biomarker挖掘鑒定演練（二） |
生存分析及結果可視化：
1）生存分析、cox模型基本原理介紹 2）模型評估基本原理介紹 3）R語言進行生存分析、生存曲線繪制 4）R語言單變量、多變量cox模型構建 5）R語言條件邏輯回歸模型構建 6）R語言ROC曲線評估模型 7）HR、OR值計算，模型解釋 |
理論
+實戰(zhàn) |
| 基于公共數(shù)據的Biomarker挖掘鑒定演練（三） |
生物分子網絡分析及可視化：
1）網絡簡介 2）網絡分析（拓撲結構分析、關鍵基因識別） 3）生物分子網絡介紹 4）利用string數(shù)據庫查詢基因/蛋白相互作用 a.單個基因/蛋白生成相互作用網絡 b.多個基因/蛋白相互作用網絡分析 c.調研靶標信息少時如何拓展 5）利用cytoscape工具構建相互作用網絡并分析 |
理論
+實戰(zhàn) |
|
| 第四天 | 多組學數(shù)據聯(lián)合分析演練（一） | 1、表觀組高通量數(shù)據原理
2、甲基化與轉錄組整合分析思路 3、表觀組公共數(shù)據庫：ENCODE、regulomeDB |
理論 |
| 1、甲基化數(shù)據預處理
2、差異甲基化位點及區(qū)域識別 3、差異分析結果可視化 |
實戰(zhàn) | ||
| 多組學數(shù)據聯(lián)合分析演練（二） |
lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練
1）lncRNA表達譜數(shù)據獲取 2）miRNA靶基因分析 3）lncRNA與mRNA表達相關性分析 4）ceRNA網絡構建及結果可視化 |
理論
+實戰(zhàn) |
注：內容以實際發(fā)生為準；若調，會提前通知。
【報名費用】
【報名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團體報名每人可減少300元；
2、4+1團報，可免費贈送一個名額；
3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；
老學員參加及推薦學員參加均可額外優(yōu)惠200元。
【掃碼報名】
【咨詢請聯(lián)系】
老師：vicolee2021（微信）
【注】開課前一周會發(fā)送郵件通知；若未接到郵件通知，請電話咨詢。
本文系作者 @TIMEDOO 原創(chuàng)發(fā)布在 肽度TIMEDOO。未經許可，禁止轉載。
